RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521825.1

TSNARE1-207, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSNARE1, Length 346 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-207ENST00000521825 SP8Q8IXZ3 490 aa22.73■■□□□ 1.23
TSNARE1-207ENST00000521825 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1-207ENST00000521825 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1-207ENST00000521825 SCN4AP35499 1836 aa22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1-207ENST00000521825 FZD9O00144 591 aa22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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TSNARE1-207ENST00000521825 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 PDE8AO60658 829 aa22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.68■■□□□ 1.22
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TSNARE1-207ENST00000521825 TMC4Q7Z404 712 aa22.68■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.68■■□□□ 1.22
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TSNARE1-207ENST00000521825 E9PSI1 815 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 HSPA6P17066 643 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 SLFN5Q08AF3 891 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 MPNDQ8N594 471 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 JDP2Q8WYK2 163 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 VPS33BQ9H267 617 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 H7C1W4 665 aa22.65■■□□□ 1.22
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TSNARE1-207ENST00000521825 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 SPEF2Q9C093 1822 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-207ENST00000521825 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 GCKRQ14397 625 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.64■■□□□ 1.21
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TSNARE1-207ENST00000521825 LINS1Q8NG48 757 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 F6X3S4 739 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 PPIP5K2O43314 1243 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 FSTL1Q12841 308 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 AOC3Q16853 763 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 MIER1Q8N108 512 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 CASP7P55210 303 aa22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
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TSNARE1-207ENST00000521825 BEND3Q5T5X7 828 aa22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 GPC2Q8N158 579 aa22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.61■■□□□ 1.21
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TSNARE1-207ENST00000521825 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.6■■□□□ 1.21
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TSNARE1-207ENST00000521825 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.6■■□□□ 1.21
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TSNARE1-207ENST00000521825 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
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TSNARE1-207ENST00000521825 RTL9Q8NET4 1388 aa22.58■■□□□ 1.21
TSNARE1-207ENST00000521825 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.58■■□□□ 1.2
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TSNARE1-207ENST00000521825 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 GREM2Q9H772 168 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 POLLQ9UGP5 575 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 HACL1Q9UJ83 578 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 CSF1RP07333 972 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 APLP1P51693 650 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 CXCL9Q07325 125 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 WASHC4Q2M389 1173 aa22.54■■□□□ 1.2
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TSNARE1-207ENST00000521825 EPHX2P34913 555 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 SCNN1DP51172 638 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 CEP350Q5VT06 3117 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 ALDH1L1O75891 902 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 CHADLQ6NUI6 762 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-207ENST00000521825 SCN9AQ15858 1988 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 RIMBP2O15034 1052 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 FOXO4P98177 505 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 EYA3Q99504 573 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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