RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 NFKBIEO00221 500 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 TMC4Q7Z404 712 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 LAMB2P55268 1798 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 KIF16BQ96L93 1317 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 OLFM4Q6UX06 510 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 CTSWP56202 376 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 SP8Q8IXZ3 490 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-215ENST00000514625 GRM8O00222 908 aa22.64■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.64■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 CASP7P55210 303 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 PSMD1Q99460 953 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 PRELPP51888 382 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 BCAR3O75815 825 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 MPNDQ8N594 471 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 GREM2Q9H772 168 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 SBF1O95248 1867 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 RTL9Q8NET4 1388 aa22.58■■□□□ 1.21
FAAP20-215ENST00000514625 CSF1RP07333 972 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 SNED1Q8TER0 1413 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 UTYO14607 1347 aa22.56■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 FOXO4P98177 505 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 FAM161AQ3B820 660 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 SLC51AQ86UW1 340 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 JDP2Q8WYK2 163 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 VPS33BQ9H267 617 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 MYH3P11055 1940 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 TAF1P21675 1872 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 ITGA6P23229 1130 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 USP44Q9H0E7 712 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 PPIP5K2O43314 1243 aa22.52■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 TRIM27P14373 513 aa22.52■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.52■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 SUCLG2Q96I99 432 aa22.52■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.52■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.52■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.52■■□□□ 1.2
FAAP20-215ENST00000514625 GPSM2P81274 684 aa22.51■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.51■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 GLTPD2A6NH11 291 aa22.5■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 C6orf229H3BNL8 230 aa22.5■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.5■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 NIM1KQ8IY84 436 aa22.5■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.49■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 AOC3Q16853 763 aa22.49■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.49■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 EYA3Q99504 573 aa22.49■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.49■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 COL4A1P02462 1669 aa22.49■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.48■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 WASHC4Q2M389 1173 aa22.48■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 GGA1Q9UJY5 639 aa22.48■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 XDHP47989 1333 aa22.48■■□□□ 1.19
FAAP20-215ENST00000514625 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms