RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514472.1

FGFR4-216, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

TSL 4

Gene FGFR4, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF428Q96B54 188 aa28.99■■■□□ 2.23
FGFR4-216ENST00000514472 HYPKQ9NX55 129 aa28.99■■■□□ 2.23
FGFR4-216ENST00000514472 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
FGFR4-216ENST00000514472 MPNDQ8N594 471 aa28.98■■■□□ 2.23
FGFR4-216ENST00000514472 ZNRF3Q9ULT6 936 aa28.98■■■□□ 2.23
FGFR4-216ENST00000514472 APAF1O14727 1248 aa28.97■■■□□ 2.23
FGFR4-216ENST00000514472 VEGFBP49765 207 aa28.97■■■□□ 2.23
FGFR4-216ENST00000514472 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.96■■■□□ 2.23
FGFR4-216ENST00000514472 CXCL9Q07325 125 aa28.96■■■□□ 2.23
FGFR4-216ENST00000514472 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
FGFR4-216ENST00000514472 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.96■■■□□ 2.23
FGFR4-216ENST00000514472 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.95■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 TMC4Q7Z404 712 aa28.95■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 TNS4Q8IZW8 715 aa28.95■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 FAM89AQ96GI7 184 aa28.95■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 IFT57Q9NWB7 429 aa28.95■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 GPRC5DQ9NZD1 345 aa28.95■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 RASSF10A6NK89 507 aa28.94■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 COL4A1P02462 1669 aa28.92■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 GNAI1P63096 354 aa28.91■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 DEFB115Q30KQ5 88 aa28.9■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 FOXN1O15353 648 aa28.89■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 CIAPIN1Q6FI81 312 aa28.89■■■□□ 2.22
FGFR4-216ENST00000514472 YDJCA8MPS7 323 aa28.88■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.88■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 CDHR2Q9BYE9 1310 aa28.87■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 RAD17O75943 681 aa28.86■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 TNIP1Q15025 636 aa28.86■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.86■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 WBP1LQ9NX94 342 aa28.86■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 TRAF5O00463 557 aa28.85■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 GOLGA2Q08379 1002 aa28.85■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 CST9Q5W186 159 aa28.85■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.85■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 WASHC4Q2M389 1173 aa28.83■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.83■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 POLLQ9UGP5 575 aa28.83■■■□□ 2.21
FGFR4-216ENST00000514472 GPSM2P81274 684 aa28.82■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 PRDM10Q9NQV6 1147 aa28.82■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 THSD7BQ9C0I4 1608 aa28.81■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.81■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 AIDAQ96BJ3 306 aa28.81■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 MYD88Q99836 296 aa28.81■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 CAPN15O75808 1086 aa28.8■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 SCN9AQ15858 1988 aa28.8■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 CCDC184Q52MB2 194 aa28.79■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 TSPYL6Q8N831 410 aa28.79■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 TRPM4Q8TD43 1214 aa28.79■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 SHTN1A0MZ66 631 aa28.78■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.78■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 DBNDD1Q9H9R9 158 aa28.78■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.78■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 TLL2Q9Y6L7 1015 aa28.78■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 MYH3P11055 1940 aa28.77■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 C6orf229H3BNL8 230 aa28.77■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 PSMD14O00487 310 aa28.77■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 RIMBP2O15034 1052 aa28.77■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 DPF2Q92785 391 aa28.77■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.77■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
FGFR4-216ENST00000514472 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.76■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 CAPNS2Q96L46 248 aa28.76■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.76■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 H7C1D1 291 aa28.75■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 MICALL2Q8IY33 904 aa28.75■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 EYA3Q99504 573 aa28.75■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 PDE8AO60658 829 aa28.74■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 ECE1P42892 770 aa28.74■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 CCDC27Q2M243 656 aa28.74■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 CYP4F22Q6NT55 531 aa28.74■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 KCNQ5Q9NR82 932 aa28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms