RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 POTEIP0CG38 1075 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRU-207ENST00000492954 POTEJP0CG39 1038 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRU-207ENST00000492954 AOC3Q16853 763 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRU-207ENST00000492954 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRU-207ENST00000492954 G2E3Q7L622 706 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRU-207ENST00000492954 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRU-207ENST00000492954 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRU-207ENST00000492954 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRU-207ENST00000492954 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
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PTPRU-207ENST00000492954 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
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PTPRU-207ENST00000492954 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRU-207ENST00000492954 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
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PTPRU-207ENST00000492954 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRU-207ENST00000492954 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRU-207ENST00000492954 TAF1P21675 1872 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRU-207ENST00000492954 COL4A1P02462 1669 aa23.13■■□□□ 1.29
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PTPRU-207ENST00000492954 HACL1Q9UJ83 578 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRU-207ENST00000492954 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRU-207ENST00000492954 VAMP4O75379 141 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRU-207ENST00000492954 IGKV5-2P06315 115 aa23.12■■□□□ 1.29
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PTPRU-207ENST00000492954 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.1■■□□□ 1.29
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PTPRU-207ENST00000492954 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRU-207ENST00000492954 SCN4AP35499 1836 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRU-207ENST00000492954 PDE8AO60658 829 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-207ENST00000492954 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.09■■□□□ 1.29
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PTPRU-207ENST00000492954 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.08■■□□□ 1.29
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PTPRU-207ENST00000492954 GPSM2P81274 684 aa23.07■■□□□ 1.28
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PTPRU-207ENST00000492954 POLLQ9UGP5 575 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRU-207ENST00000492954 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRU-207ENST00000492954 LTBP1Q14766 1721 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRU-207ENST00000492954 C6orf229H3BNL8 230 aa23.03■■□□□ 1.28
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PTPRU-207ENST00000492954 H7C1W4 665 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRU-207ENST00000492954 RAD17O75943 681 aa23.02■■□□□ 1.28
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PTPRU-207ENST00000492954 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.01■■□□□ 1.27
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PTPRU-207ENST00000492954 GCKRQ14397 625 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRU-207ENST00000492954 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.01■■□□□ 1.27
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PTPRU-207ENST00000492954 F6X3S4 739 aa23■■□□□ 1.27
PTPRU-207ENST00000492954 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
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PTPRU-207ENST00000492954 LINS1Q8NG48 757 aa23■■□□□ 1.27
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PTPRU-207ENST00000492954 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
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PTPRU-207ENST00000492954 UFL1O94874 794 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRU-207ENST00000492954 CASP7P55210 303 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRU-207ENST00000492954 TNIP1Q15025 636 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRU-207ENST00000492954 CNTROBQ8N137 903 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRU-207ENST00000492954 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRU-207ENST00000492954 EYA3Q99504 573 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRU-207ENST00000492954 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRU-207ENST00000492954 PCNTO95613 3336 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRU-207ENST00000492954 DOK7Q18PE1 504 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRU-207ENST00000492954 CREBZFQ9NS37 354 aa22.97■■□□□ 1.27
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