RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484474.1

ERBB4-208, Transcript of erb-b2 receptor tyrosine kinase 4, human

TSL 3

Gene ERBB4, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERBB4-208	ENST00000484474	TTLL8	A6PVC2	850 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	NME9	Q86XW9	330 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	RUNDC1	Q96C34	613 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	POLK	Q9UBT6	870 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	LILRA1	O75019	489 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	SLAIN2	Q9P270	581 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	AKAP12	Q02952	1782 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	SBNO1	A3KN83	1393 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	FOXO3	O43524	673 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	7.35	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	NEUROD2	Q15784	382 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	STRC	Q7RTU9	1775 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	MST1R	Q04912	1400 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	AMPH	P49418	695 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	PTS	Q03393	145 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	CCDC27	Q2M243	656 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	ORAI2	Q96SN7	254 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	KIF1A	Q12756	1690 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ERBB4-208	ENST00000484474	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		7.34	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	ARHGEF10	O15013	1369 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	GPR37L1	O60883	481 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	ADH1A	P07327	375 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	RTL1	A6NKG5	1358 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	FLT4	P35916	1363 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	SLC35F4	A4IF30	521 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	ZBBX	A8MT70	800 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	IL13	P35225	146 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	WDR63	Q8IWG1	891 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	BANK1	Q8NDB2	785 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	IL27	Q8NEV9	243 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474		E9PSI1	815 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	APAF1	O14727	1248 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	TOM1	O60784	492 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	GC	P02774	474 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	NEFL	P07196	543 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	CCDC125	Q86Z20	511 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	RNF217	Q8TC41	542 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	IP6K1	Q92551	441 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	FBXO45	P0C2W1	286 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	RELB	Q01201	579 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	KRT76	Q01546	638 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	BRINP3	Q76B58	766 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	USP19	O94966	1318 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	IL16	Q14005	1332 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	PTGIR	P43119	386 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	USP54	Q70EL1	1684 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	ZNF521	Q96K83	1311 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ERBB4-208	ENST00000484474	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24

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