RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480665.1

TNS1-216, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 758 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-216ENST00000480665 SCN9AQ15858 1988 aa19.67■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 SHTN1A0MZ66 631 aa19.67■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 APAF1O14727 1248 aa19.67■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 FOXN1O15353 648 aa19.67■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 FAM89AQ96GI7 184 aa19.67■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 RASSF10A6NK89 507 aa19.66■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 KIAA2012Q0VF49 1180 aa19.66■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 NIM1KQ8IY84 436 aa19.66■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 GPRC5DQ9NZD1 345 aa19.66■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 TRAF5O00463 557 aa19.65■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 BBOX1O75936 387 aa19.65■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa19.65■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 CLEC11AQ9Y240 323 aa19.65■□□□□ 0.74
TNS1-216ENST00000480665 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 CST9Q5W186 159 aa19.64■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 C8orf58Q8NAV2 365 aa19.64■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 VPS33BQ9H267 617 aa19.64■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 ZNRF3Q9ULT6 936 aa19.64■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 TNS4Q8IZW8 715 aa19.63■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 MPNDQ8N594 471 aa19.63■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 IFT57Q9NWB7 429 aa19.63■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 TSPYL6Q8N831 410 aa19.62■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 TRPM4Q8TD43 1214 aa19.62■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 RTL9Q8NET4 1388 aa19.61■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 RAD17O75943 681 aa19.61■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 HYPKQ9NX55 129 aa19.61■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 WBP1LQ9NX94 342 aa19.61■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 GPSM2P81274 684 aa19.6■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 KCNQ5Q9NR82 932 aa19.6■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 POLLQ9UGP5 575 aa19.6■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 PSME4Q14997 1843 aa19.6■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 EGFRP00533 1210 aa19.59■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 SUPT20HQ8NEM7 779 aa19.59■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 SEC31BQ9NQW1 1179 aa19.59■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 PGAP2Q9UHJ9 254 aa19.59■□□□□ 0.73
TNS1-216ENST00000480665 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 CIAPIN1Q6FI81 312 aa19.58■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 DLK2Q6UY11 383 aa19.58■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 CDHR2Q9BYE9 1310 aa19.57■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 CAPN15O75808 1086 aa19.57■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 DEFB115Q30KQ5 88 aa19.57■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 SPEF2Q9C093 1822 aa19.57■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 GNAI1P63096 354 aa19.56■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 MYD88Q99836 296 aa19.56■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 DBNDD1Q9H9R9 158 aa19.56■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 PSMD14O00487 310 aa19.55■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 IGKV5-2P06315 115 aa19.55■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 TMC4Q7Z404 712 aa19.55■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 TLL2Q9Y6L7 1015 aa19.55■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 CYP4F22Q6NT55 531 aa19.54■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 TBC1D16Q8TBP0 767 aa19.54■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 MYH3P11055 1940 aa19.54■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.53■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 PRDM10Q9NQV6 1147 aa19.53■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 RIMBP2O15034 1052 aa19.52■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 RPS8P62241 208 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 GOLGA2Q08379 1002 aa19.52■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 WASHC4Q2M389 1173 aa19.52■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 G2E3Q7L622 706 aa19.52■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 SAPCD2Q86UD0 394 aa19.52■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 MICALL2Q8IY33 904 aa19.52■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 CAPNS2Q96L46 248 aa19.52■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 PODXL2Q9NZ53 605 aa19.52■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
TNS1-216ENST00000480665 ECE2O60344 883 aa19.51■□□□□ 0.71
TNS1-216ENST00000480665 LBX1P52954 281 aa19.51■□□□□ 0.71
TNS1-216ENST00000480665 DOK7Q18PE1 504 aa19.51■□□□□ 0.71
TNS1-216ENST00000480665 SAMD7Q7Z3H4 446 aa19.51■□□□□ 0.71
TNS1-216ENST00000480665 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.51■□□□□ 0.71
TNS1-216ENST00000480665 ZNF609O15014 1411 aa19.51■□□□□ 0.71
TNS1-216ENST00000480665 AOC2O75106 756 aa19.5■□□□□ 0.71
TNS1-216ENST00000480665 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms