RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 H7C1W4 665 aa31.75■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 PDE8AO60658 829 aa31.75■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP31.75■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 BEND3Q5T5X7 828 aa31.75■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa31.74■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 SMC4Q9NTJ3 1288 aa31.74■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa31.74■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 MYH3P11055 1940 aa31.73■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 SLC4A10Q6U841 1118 aa31.73■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 SNED1Q8TER0 1413 aa31.73■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 PTPRCP08575 1304 aa31.73■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 GRIPAP1Q4V328 841 aa31.72■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 ZBED9Q6R2W3 1325 aa31.71■■■□□ 2.67
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC152Q4G0S7 254 aa31.7■■■□□ 2.67
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CXCL2-201ENST00000296031 CASP7P55210 303 aa31.68■■■□□ 2.66
CXCL2-201ENST00000296031 CTSWP56202 376 aa31.68■■■□□ 2.66
CXCL2-201ENST00000296031 TMC4Q7Z404 712 aa31.68■■■□□ 2.66
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CXCL2-201ENST00000296031 SEC31BQ9NQW1 1179 aa31.67■■■□□ 2.66
CXCL2-201ENST00000296031 ALDH1L1O75891 902 aa31.66■■■□□ 2.66
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CXCL2-201ENST00000296031 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
CXCL2-201ENST00000296031 PLA2G12BQ9BX93 195 aa31.64■■■□□ 2.66
CXCL2-201ENST00000296031 GRM8O00222 908 aa31.62■■■□□ 2.65
CXCL2-201ENST00000296031 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
CXCL2-201ENST00000296031 KDM2BQ8NHM5 1336 aa31.62■■■□□ 2.65
CXCL2-201ENST00000296031 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
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CXCL2-201ENST00000296031 GREM2Q9H772 168 aa31.61■■■□□ 2.65
CXCL2-201ENST00000296031 SPEF2Q9C093 1822 aa31.59■■■□□ 2.65
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CXCL2-201ENST00000296031 NMRK2Q9NPI5 230 aa31.59■■■□□ 2.65
CXCL2-201ENST00000296031 GLTPD2A6NH11 291 aa31.58■■■□□ 2.65
CXCL2-201ENST00000296031 CSF1RP07333 972 aa31.58■■■□□ 2.65
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa31.58■■■□□ 2.65
CXCL2-201ENST00000296031 SUPT20HQ8NEM7 779 aa31.58■■■□□ 2.65
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CXCL2-201ENST00000296031 LARGE2Q8N3Y3 721 aa31.56■■■□□ 2.64
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CXCL2-201ENST00000296031 JDP2Q8WYK2 163 aa31.55■■■□□ 2.64
CXCL2-201ENST00000296031 VPS33BQ9H267 617 aa31.55■■■□□ 2.64
CXCL2-201ENST00000296031 DUOX1Q9NRD9 1551 aa31.55■■■□□ 2.64
CXCL2-201ENST00000296031 KIF3CO14782 793 aa31.54■■■□□ 2.64
CXCL2-201ENST00000296031 GPSM2P81274 684 aa31.54■■■□□ 2.64
CXCL2-201ENST00000296031 AOC3Q16853 763 aa31.54■■■□□ 2.64
CXCL2-201ENST00000296031 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
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CXCL2-201ENST00000296031 LTBP1Q14766 1721 aa31.52■■■□□ 2.64
CXCL2-201ENST00000296031 UTYO14607 1347 aa31.52■■■□□ 2.64
CXCL2-201ENST00000296031 BCAR3O75815 825 aa31.52■■■□□ 2.64
CXCL2-201ENST00000296031 ITGA6P23229 1130 aa31.52■■■□□ 2.64
CXCL2-201ENST00000296031 CHMP3Q9Y3E7 222 aa31.52■■■□□ 2.64
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF541Q9H0D2 1346 aa31.51■■■□□ 2.64
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CXCL2-201ENST00000296031 FZD9O00144 591 aa31.5■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 DDNO94850 711 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
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CXCL2-201ENST00000296031 USP44Q9H0E7 712 aa31.49■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 PODXL2Q9NZ53 605 aa31.49■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa31.49■■■□□ 2.63
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CXCL2-201ENST00000296031 KIAA2012Q0VF49 1180 aa31.48■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 POLLQ9UGP5 575 aa31.48■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa31.47■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 KAZALD1Q96I82 304 aa31.47■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 EIF6P56537 245 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 TBC1D16Q8TBP0 767 aa31.46■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 UFL1O94874 794 aa31.45■■■□□ 2.63
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