RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A1W2PPZ6 126 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCDC188H7C350 402 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 M0R233 179 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 AKAP10O43572 662 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 SYNGR3O43761 229 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 RP2O75695 350 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 URI1O94763 535 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 TCP1P17987 556 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 KIAA0040Q15053 153 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 DCAF12L2Q5VW00 463 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 AAED1Q7RTV5 226 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 C1QL4Q86Z23 238 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 SYT14Q8NB59 555 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 PPCDCQ96CD2 204 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ERP44Q9BS26 406 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 SH3BP4Q9P0V3 963 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 CMAHPQ9Y471 501 aa8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 PIP5K1BO14986 540 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ANKRD28O15084 1053 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 TBX19O60806 448 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 NCR1O76036 304 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 GSNP06396 782 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 IMPDH2P12268 514 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 CBR1P16152 277 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCNA2P20248 432 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ALDH3B1P43353 468 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 EVX1P49640 407 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 SEC24CP53992 1094 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 PLTPP55058 493 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 PKNOX1P55347 436 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC35A1P78382 337 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 DAG1Q14118 895 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 IMPG1Q17R60 797 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 TEX35Q5T0J7 233 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 KRT80Q6KB66 452 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 LEG1Q6P5S2 330 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 LINGO2Q7L985 606 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR9K2Q8NGE7 335 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 SDF2Q99470 211 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 MMP27Q9H306 513 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 REEP4Q9H6H4 257 aa8.94□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCDC151A5D8V7 595 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 KRT33AO76009 404 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 CSTAP01040 98 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 IMPDH1P20839 514 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 NR4A1P22736 598 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 OMGP23515 440 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 LCP2Q13094 533 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 BAMBIQ13145 260 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 PDE7AQ13946 482 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPR68Q15743 365 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF141Q15928 474 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 AVPI1Q5T686 147 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 PAQR6Q6TCH4 344 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 GRINAQ7Z429 371 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM99Q8N816 258 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF563Q8TA94 476 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 FBXO25Q8TCJ0 367 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF416Q9BWM5 594 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 NMUR2Q9GZQ4 415 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 NOX3Q9HBY0 568 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF69Q9UC07 566 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCL27Q9Y4X3 112 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.92□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 FCMRO60667 390 aa8.92□□□□□ -0.98
CTDNEP1-202ENST00000570380 SEC22BO75396 215 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms