RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 GGTLC2Q14390 218 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 GANABQ14697 944 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 GCNT6Q5T4J0 391 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 DTX2Q86UW9 622 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 RNF130Q86XS8 419 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF619Q8N2I2 560 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 HIPK4Q8NE63 616 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 CANT1Q8WVQ1 401 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 HSD17B8Q92506 261 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 SLCO4A1Q96BD0 722 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 COL21A1Q96P44 957 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 ITPAQ9BY32 194 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 C12orf49Q9H741 205 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 YY1AP1Q9H869 796 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 FOLH1BQ9HBA9 442 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF639Q9UID6 485 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 USP22Q9UPT9 525 aa8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa8.25□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 SLC35F4A4IF30 521 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 OR6C70A6NIJ9 312 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 TTC36A6NLP5 189 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 DUXAA6NLW8 204 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 UPK1AO00322 258 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 ZIC3O60481 467 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 AQP8O94778 261 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 PRSS23O95084 383 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 SYNGR4O95473 234 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 IFNA14P01570 189 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 CD8AP01732 235 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 SEMG1P04279 462 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 TFPTP0C1Z6 253 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 BMP4P12644 408 aa8.25□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 ETFAP13804 333 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 NCK1P16333 377 aa8.25□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 SOAT1P35610 550 aa8.25□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 CDK6Q00534 326 aa8.25□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 EFR3AQ14156 821 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 GNA13Q14344 377 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 GUSBP1Q15486 140 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 SPDYE7PQ495Y7 208 aa8.25□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 REEP3Q6NUK4 255 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 CBLL1Q75N03 491 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 OR9A2Q8NGT5 310 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 PMM1Q92871 262 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 TMBIM1Q969X1 311 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 C3orf49Q96BT1 292 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 GIMAP5Q96F15 307 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf159Q96HA4 380 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 MS4A4EQ96PG1 132 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 ADOQ96SZ5 270 aa8.25□□□□□ -1.09
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SMAD3-215ENST00000560424 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 PRODH2Q9UF12 536 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 ANGPT4Q9Y264 503 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.25□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 H0YJX3 145 aa8.24□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 HMGN4O00479 90 aa8.24□□□□□ -1.09
SMAD3-215ENST00000560424 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
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