RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 IMPDH2P12268 514 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 LBPP18428 481 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 USF1P22415 310 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CXCR1P25024 350 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC1A3P43003 542 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC1A6P48664 564 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 EFNA4P52798 201 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 PRPS1P60891 318 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 H3F3AP84243 136 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 VLDLRP98155 873 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC25A3Q00325 362 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 PLAURQ03405 335 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CEACAM7Q14002 265 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CASP8Q14790 479 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 OR7A5Q15622 319 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 DPY19L1Q2PZI1 675 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ELOA3BQ3SY89 546 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 AAED1Q7RTV5 226 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CMIPQ8IY22 773 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ELOA3Q8NG57 546 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 C10orf105Q8TEF2 133 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 TESCQ96BS2 214 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 C3orf49Q96BT1 292 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 KCNS3Q9BQ31 491 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SHARPINQ9H0F6 387 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CHODLQ9H9P2 273 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC17A5Q9NRA2 495 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 DCTN4Q9UJW0 460 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 MOKQ9UQ07 419 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 RAP2CQ9Y3L5 183 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A096LNT2 108 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CCDC154A6NI56 674 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 AGAP5A6NIR3 686 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 PDLIM1O00151 329 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 GPIP06744 558 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CHRM4P08173 479 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CSF3P09919 207 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 MPGP29372 298 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 UFM1P61960 85 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 GGTLC2Q14390 218 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC17A1Q14916 467 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 KRT71Q3SY84 523 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 HIKESHIQ53FT3 197 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM225Q6GV28 225 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 PAQR6Q6TCH4 344 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CADM2Q8N3J6 435 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM99Q8N816 258 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 PROX1Q92786 737 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ZBTB9Q96C00 473 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 TAPBPLQ9BX59 468 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 C20orf27Q9GZN8 174 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC38A1Q9H2H9 487 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CENPHQ9H3R5 247 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ADPRHL2Q9NX46 363 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 LPAR3Q9UBY5 353 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 BTNL2Q9UIR0 455 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 FKBP7Q9Y680 259 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 BIRC5O15392 142 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 DBIP07108 87 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 GKN3PP0CG01 181 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 IGHV4-31P0DP07 118 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 BGNP21810 368 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CDKN2CP42773 168 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 PDLIM4P50479 330 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 MAP2K6P52564 334 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 COPZ1P61923 177 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 EPS8Q12929 822 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 VHLLQ6RSH7 139 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SPATA19Q7Z5L4 167 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 PEX5LQ8IYB4 626 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 POMGNT2Q8NAT1 580 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 OR9K2Q8NGE7 335 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 TEX37Q96LM6 180 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CCDC115Q96NT0 180 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 OR52E6Q96RD3 313 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ZBTB18Q99592 522 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 KCNK9Q9NPC2 374 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 PNPOQ9NVS9 261 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms