RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 HMGCS1Q01581 520 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ENPP2Q13822 863 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 YIF1BQ5BJH7 314 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 REEP3Q6NUK4 255 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 GPR26Q8NDV2 337 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FAM110BQ8TC76 370 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SLC2A12Q8TD20 617 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PTP4A1Q93096 173 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 RAB24Q969Q5 203 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SLAMF9Q96A28 289 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TXN2Q99757 166 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 NOX3Q9HBY0 568 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SCN8AQ9UQD0 1980 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 A0A0A6YYJ9 748 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FAM221BA6H8Z2 402 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ARRDC5A6NEK1 342 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 HSPB2A8KAH6 182 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 B4E171 279 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CCL16O15467 120 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FABP4P15090 132 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 NFYBP25208 207 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 HTR2CP28335 458 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SLC6A6P31641 620 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 GABRA5P31644 462 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CD96P40200 585 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PRLHRP49683 370 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 HSPB2Q16082 182 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 C4orf17Q53FE4 359 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PRSS36Q5K4E3 855 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SLC9B2Q86UD5 537 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR8D4Q8NGM9 314 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 WFDC5Q8TCV5 224 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TIMM29Q9BSF4 260 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CLMPQ9H6B4 373 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 A8MXE2 369 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SEC14L6B5MCN3 397 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FXYD1O00168 92 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 MGMTP16455 207 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TBPP20226 339 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 DNASE1L1P49184 302 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 DPTQ07507 201 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 MAP4K2Q12851 820 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SLC17A1Q14916 467 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TEAD2Q15562 447 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PLK5Q496M5 336 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CPZQ66K79 652 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 GPR139Q6DWJ6 353 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 KLBQ86Z14 1044 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 GGHQ92820 318 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FBXO17Q96EF6 278 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 WBP1LQ9NX94 342 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TAS2R16Q9NYV7 291 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 GDE1Q9NZC3 331 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 LRFN1Q9P244 771 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OSGIN1Q9UJX0 560 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 GPR34Q9UPC5 381 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 GJE1A6NN92 205 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 BPNT1O95861 308 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 IFNGR1P15260 489 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF20P17024 532 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 AKR1C4P17516 323 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FRKP42685 505 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CLDN20P56880 219 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR12D2P58182 307 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TLE4Q04727 773 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 XKR6Q5GH73 641 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PDZD3Q86UT5 571 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SERPINA12Q8IW75 414 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PROKR1Q8TCW9 393 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 VWCEQ96DN2 955 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 HRASLS5Q96KN8 279 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD19PQ9H560 264 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SFXN1Q9H9B4 322 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF226Q9NYT6 803 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FZD4Q9ULV1 537 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 A0A0A6YYH2 397 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 A0A0B4J2A0 478 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1B0GUH1 482 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 A6NJ64 397 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ELFN1P0C7U0 828 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 AKAIN1P0CW23 69 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 LIPCP11150 499 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms