RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531244.1

PPP6R3-222, Transcript of protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, human

TSL 5

Gene PPP6R3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP6R3-222	ENST00000531244	CXCR2	P25025	360 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	IMPA1	P29218	277 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	PPP2R1B	P30154	601 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	CDA	P32320	146 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	KDELR2	P33947	212 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	PCGF2	P35227	344 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	MMP12	P39900	470 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	DCT	P40126	519 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	SSR2	P43308	183 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR1E2	P47887	323 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	SLC6A12	P48065	614 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	ALDH3B2	P48448	385 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	CAMP	P49913	170 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	HLCS	P50747	726 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	CCR8	P51685	355 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	CLCNKA	P51800	687 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	UGT2B15	P54855	530 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	GABARAPL2	P60520	117 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	DSTN	P60981	165 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	IL18R1	Q13478	541 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	CAMK2D	Q13557	499 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	RAPSN	Q13702	412 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF234	Q14588	700 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF846	Q147U1	533 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	PDGFRL	Q15198	375 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	MAPK11	Q15759	364 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	NPTX1	Q15818	432 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	DGUOK	Q16854	277 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	TRIM16L	Q309B1	348 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	GPAT3	Q53EU6	434 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	PYCR3	Q53H96	274 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF691	Q5VV52	312 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	VIT	Q6UXI7	678 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	MTSS1L	Q765P7	747 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	AMZ2	Q86W34	360 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	RNF130	Q86XS8	419 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	SMYD1	Q8NB12	490 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR7G3	Q8NG95	312 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	TANK	Q92844	425 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	MYDGF	Q969H8	173 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	MAL2	Q969L2	176 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	CEP19	Q96LK0	163 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	C12orf66	Q96MD2	445 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	QRFPR	Q96P65	431 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	DGAT2	Q96PD7	388 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	LYSMD1	Q96S90	227 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	LITAF	Q99732	161 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	KXD1	Q9BQD3	176 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	PLK3	Q9H4B4	646 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	CLN6	Q9NWW5	311 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	RHCG	Q9UBD6	479 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		3	□□□□□ -1.93
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		3	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms