RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530235.1

RBM4-211, Transcript of RNA binding motif protein 4, human

TSL 3 BASIC

Gene RBM4, Length 1,011 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4-211	ENST00000530235	ALG1L2	C9J202	215 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	SCD	O00767	359 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	C1QC	P02747	245 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	IL6	P05231	212 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	NGFR	P08138	427 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	OR12D1	P0DN82	309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	EDNRA	P25101	427 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	CDKN2C	P42773	168 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	OR3A2	P47893	321 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62	5e-7	■□□□□ 9.9
RBM4-211	ENST00000530235	FOXF1	Q12946	379 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	SAXO2	Q658L1	398 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	RINL	Q6ZS11	566 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	POC1B	Q8TC44	478 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	RAB8B	Q92930	207 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	NEURL3	Q96EH8	262 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	SDF2	Q99470	211 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	CIB4	A0PJX0	185 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	C7orf72	A4D263	438 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	OR5H1	A6NKK0	313 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	RFXANK	O14593	260 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	ANP32D	O95626	131 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	NUDT14	O95848	222 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	IGHV3-9	P01782	118 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	ENPP1	P22413	925 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	IGHV1-2	P23083	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	PTAFR	P25105	342 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	CD40	P25942	277 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	KHK	P50053	298 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	ZNF614	Q8N883	585 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	ZNF527	Q8NB42	609 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	VPS33A	Q96AX1	596 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	FBXO17	Q96EF6	278 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	SOX7	Q9BT81	388 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	RMND5A	Q9H871	391 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	EXD2	Q9NVH0	621 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4-211	ENST00000530235		A0A1W2PQD3	144 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	LRP5L	A4QPB2	252 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	VWC2L	B2RUY7	222 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	NR5A2	O00482	541 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	VENTX	O95231	258 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	AGR2	O95994	175 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	AK1	P00568	194 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	SLC7A1	P30825	629 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	ATP12A	P54707	1039 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	GPR68	Q15743	365 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	CD226	Q15762	336 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	ZSCAN26	Q16670	478 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	ZNF544	Q6NX49	715 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	RNF130	Q86XS8	419 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	ITCH	Q96J02	903 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	GP6	Q9HCN6	339 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	HHATL	Q9HCP6	504 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235		A0A1W2PNR3	127 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	GJE1	A6NN92	205 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	NDUFS8	O00217	210 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	FCMR	O60667	390 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	STX11	O75558	287 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	KRT75	O95678	551 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM4-211	ENST00000530235	ZNF23	P17027	643 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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