RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	NCALD	P61601	193 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	H3F3A	P84243	136 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	FAP	Q12884	760 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	CEACAM7	Q14002	265 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	OR7A5	Q15622	319 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	REEP3	Q6NUK4	255 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	NFKBID	Q8NI38	313 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	STON2	Q8WXE9	905 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	FBXW5	Q969U6	566 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	C18orf12	Q96KH6	178 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	MALT1	Q9UDY8	824 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	HIVEP1	P15822	2718 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A1W2PP18	115 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	LIPT2	A6NK58	231 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	OR5H1	A6NKK0	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ANGPT2	O15123	496 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	RAD51D	O75771	328 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	AHSA1	O95433	338 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	PLAU	P00749	431 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ARAF	P10398	606 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC6A2	P23975	617 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	PRKAR1B	P31321	381 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	CDK6	Q00534	326 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TGFBR3	Q03167	851 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	BSPH1	Q075Z2	132 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC17A1	Q14916	467 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM225	Q6GV28	225 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SERPINA11	Q86U17	422 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	BIVM	Q86UB2	503 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	GPAT4	Q86UL3	456 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ELOA3	Q8NG57	546 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF607	Q96SK3	696 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	GSX2	Q9BZM3	304 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	NPHS2	Q9NP85	383 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	VAPA	Q9P0L0	249 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	AQP7P3	A6NL99	342 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	FRS3	O43559	492 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	RAMP1	O60894	148 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SERPINB7	O75635	380 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	KRT33A	O76009	404 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	AKR7A3	O95154	331 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	VAMP5	O95183	116 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	PRG2	P13727	222 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	EDNRA	P25101	427 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	PTH2R	P49190	550 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	BNIP2	Q12982	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SCARB2	Q14108	478 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	AAED1	Q7RTV5	226 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM99	Q8N816	258 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	STK35	Q8TDR2	534 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM45B	Q96B21	275 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	C3orf49	Q96BT1	292 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	RADIL	Q96JH8	1075 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393		Q96MF0	132 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	BDH2	Q9BUT1	245 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	PIF1	Q9H611	641 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	DLL4	Q9NR61	685 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SELENON	Q9NZV5	590 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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