RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	CLCC1	Q96S66	551 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ABI3	Q9P2A4	366 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	POLH	Q9Y253	713 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GV50	99 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM129	A0AVI4	362 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193		H0Y8X5	98 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RFXAP	O00287	272 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	OR2T1	O43869	369 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SNAPC5	O75971	98 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	KNG1	P01042	644 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TCRB	P04435	133 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	OR2T7	P0C7T2	308 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF43	P17038	809 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	CTGF	P29279	349 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	EFR3A	Q14156	821 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	OR7A5	Q15622	319 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SLC6A19	Q695T7	634 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	OR2T27	Q8NH04	317 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	OR52N1	Q8NH53	320 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35A4	Q96G79	324 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SHD	Q96IW2	340 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193		Q96M85	177 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TEAD3	Q99594	435 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	HDAC8	Q9BY41	377 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	HHLA2	Q9UM44	414 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PEX14	O75381	377 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	AKAIN1	P0CW23	69 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM225B	P0DP42	221 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	HTR2A	P28223	471 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	CRABP1	P29762	137 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	BSG	P35613	385 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	WNT3	P56703	355 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	FGL1	Q08830	312 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	CCIN	Q13939	588 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	BEX5	Q5H9J7	111 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM99	Q8N816	258 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PATE1	Q8WXA2	126 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	MYADM	Q96S97	322 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SDF2	Q99470	211 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193		F5H5K5	113 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	YY2	O15391	372 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SLC43A1	O75387	559 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	UBL3	O95164	117 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PKLR	P30613	574 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	LBX1	P52954	281 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	LIM2	P55344	173 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	HSD11B2	P80365	405 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	PLGLB1	Q02325	96 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	GPR50	Q13585	617 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RTL10	Q7L3V2	364 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.21
NEK1-208	ENST00000512193	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01553	A4QN01	128 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SERINC4	A6NH21	518 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193		M0R082	166 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF264	O43296	627 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SBK2	P0C263	348 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CLU	P10909	449 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TACR3	P29371	465 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SOX18	P35713	384 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC6A8	P48029	635 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms