RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ZFYVE9O95405 1425 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 PRSS37A4D1T9 235 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC30A6NM36 301 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 GJE1A6NN92 205 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 SSNA1O43805 119 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 CHST1O43916 411 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 MGRN1O60291 552 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 UGT2B17O75795 530 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 OR2B3O76000 313 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 IFNA10P01566 189 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 EPOP01588 193 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 S100A8P05109 93 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 RHOCP08134 193 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 FBP1P09467 338 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ETFAP13804 333 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 KITLGP21583 273 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 CA4P22748 312 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 EPHA2P29317 976 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 MATKP42679 507 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 CAV2P51636 162 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 RAP1BP61224 184 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 DGUOKQ16854 277 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 EMBQ6PCB8 327 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 DRAM2Q6UX65 266 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 LINGO2Q7L985 606 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 MOB3BQ86TA1 216 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 COMMD2Q86X83 199 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 GPSM1Q86YR5 675 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 EXD3Q8N9H8 876 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 PEX11GQ96HA9 241 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 IGSF21Q96ID5 467 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 TXNDC15Q96J42 360 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 DEFB118Q96PH6 123 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 FRG2BQ96QU4 278 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 JMJD8Q96S16 334 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ECSITQ9BQ95 431 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 NOX4Q9NPH5 578 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGEF10O15013 1369 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ATP10AO60312 1499 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 FEZF1A0PJY2 475 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 OR11H12B2RN74 326 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 H3BNX3 289 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ARPC5O15511 151 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 SYT7O43581 403 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 GJB5O95377 273 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM50AO95807 157 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 TSPAN13O95857 204 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 KLK1P06870 262 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 C4BPBP20851 252 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 GKP32189 559 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 TNFSF9P41273 254 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 GLIPR1P48060 266 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 TTPAP49638 278 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 PRLHRP49683 370 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 MEOX1P50221 254 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 CXADRP78310 365 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 CDH18Q13634 790 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF528Q3MIS6 628 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 LCE4AQ5TA78 99 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 FAHD1Q6P587 224 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 UQCC3Q6UW78 93 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 CHSY1Q86X52 802 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 IFT20Q8IY31 132 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 STPG3Q8N7X2 389 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 TERB1Q8NA31 727 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms