RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM64	Q6YI46	380 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	CENPU	Q71F23	418 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	PEX26	Q7Z412	305 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	IFNE	Q86WN2	208 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	OR2L5	Q8NG80	312 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	RDH11	Q8TC12	318 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	DPF1	Q92782	380 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	STARD4	Q96DR4	205 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	SMIM10	Q96HG1	83 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	OR4K3	Q96R72	315 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	NTMT1	Q9BV86	223 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	UBQLN3	Q9H347	655 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	ACTR8	Q9H981	624 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	PROK2	Q9HC23	129 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	LYRM4	Q9HD34	91 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	NLK	Q9UBE8	527 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	DKKL1	Q9UK85	242 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	TFR2	Q9UP52	801 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	LIPT1	Q9Y234	373 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	LRIT2	A6NDA9	550 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	CXorf65	A6NEN9	183 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	OR6C76	A6NM76	312 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	PGRMC2	O15173	223 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	LIAS	O43766	372 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	SSX4	O60224	188 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	KIAA0513	O60268	411 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	GPRIN2	O60269	458 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	LMX1B	O60663	402 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	PEX11A	O75192	247 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	TGM6	O95932	706 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	FTCD	O95954	541 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	PAH	P00439	452 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	IGHV4-39	P01824	125 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	LCK	P06239	509 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	SOD3	P08294	240 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	ETS1	P14921	441 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	GNAZ	P19086	355 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	CPN2	P22792	545 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	PTPN6	P29350	595 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	CCKAR	P32238	428 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	CDKN1A	P38936	164 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	CASP3	P42574	277 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	SLC1A2	P43004	574 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	SSR2	P43308	183 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	STAR	P49675	285 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	DSCR9	P59020	149 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	HERVK_113	P63132	956 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	ERVK-8	P63133	956 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	BIK	Q13323	160 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	SQLE	Q14534	574 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	GSTA3	Q16772	222 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	MTX3	Q5HYI7	312 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	C4orf22	Q6V702	233 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-209	ENST00000464936	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		3.99	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms