RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 LRRN3E7EW58 273 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IMPA2O14732 288 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MYL12BO14950 172 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SEC14L5O43304 696 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IDH3BO43837 385 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SNX4O95219 450 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IL1AP01583 271 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 BGLAPP02818 100 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SBK2P0C263 348 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CLUP10909 449 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PNMTP11086 282 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ALAS2P22557 587 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TGM1P22735 817 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ABCD3P28288 659 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SLC6A8P48029 635 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ARL4DP49703 201 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CLK1P49759 484 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 DIO1P49895 249 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A1P53007 311 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 IL10RAQ13651 578 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GALEQ14376 348 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NSDHLQ15738 373 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LIPKQ5VXJ0 399 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NHLRC1Q6VVB1 395 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OAFQ86UD1 273 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LHFPL3Q86UP9 236 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf210Q8IVY1 113 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ARMC10Q8N2F6 343 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM105Q8N8V8 129 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF527Q8NB42 609 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SYT14Q8NB59 555 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR52L1Q8NGH7 329 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR5M3Q8NGP4 307 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 OR6S1Q8NH40 331 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR51A7Q8NH64 312 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MOSPD2Q8NHP6 518 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NUBPLQ8TB37 319 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GPR119Q8TDV5 335 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OMA1Q96E52 524 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ADOQ96SZ5 270 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 SOSTQ9BQB4 213 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IFT27Q9BW83 186 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ASPNQ9BXN1 380 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FBXL4Q9UKA2 621 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MKL2Q9ULH7 1088 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TRAPPC4Q9Y296 219 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF337Q9Y3M9 751 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR10H1Q9Y4A9 318 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 V9GYH0 126 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 DMDP11532 3685 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ALPK2Q86TB3 2170 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF318Q5VUA4 2279 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0G2JK05 382 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 OR6C68A6NDL8 312 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RIIAD1A6NNX1 92 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 C12orf71A8MTZ7 269 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PRR32B1ATL7 298 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FTCDNL1E5RQL4 147 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 E9PI62 339 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SCDO00767 359 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CTDSP2O14595 271 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 DVL2O14641 736 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEB3O15480 346 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OGG1O15527 345 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LAMTOR5O43504 91 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PLPP2O43688 288 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
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