RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 HERVK_113P61574 105 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 PRKCEQ02156 737 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 ACVR1Q04771 509 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 CXCL9Q07325 125 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 LMOD3Q0VAK6 560 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 TFDP1Q14186 410 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 SELPLGQ14242 412 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 IRF3Q14653 427 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 CDKN3Q16667 212 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 ZSWIM7Q19AV6 140 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 PCGF3Q3KNV8 242 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 C5orf47Q569G3 176 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM196Q5HYL7 178 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 CDKL4Q5MAI5 379 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 FAM69AQ5T7M9 428 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 COX15Q7KZN9 410 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 RRAGAQ7L523 313 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 GPR142Q7Z601 462 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 ANKRD37Q7Z713 158 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 LINC01551Q86U37 167 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 CATSPER3Q86XQ3 398 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 RNF130Q86XS8 419 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 GID4Q8IVV7 300 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 CDH26Q8IXH8 852 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 RIMKLAQ8IXN7 391 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 C1orf174Q8IYL3 243 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 RCOR2Q8IZ40 523 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 ALLCQ8N6M5 410 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 C4orf32Q8N8J7 132 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 CLRN3Q8NCR9 226 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 OR6F1Q8NGZ6 308 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 OR52P1PQ8NH57 321 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 JOSD2Q8TAC2 188 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 LMBR1Q8WVP7 490 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 TCP11Q8WWU5 503 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 RLN3Q8WXF3 142 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 EID2BQ96D98 161 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 MCRS1Q96EZ8 462 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 PLEKHF1Q96S99 279 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 SH3GL2Q99962 352 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 SLC2A11Q9BYW1 496 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 EDEM3Q9BZQ6 932 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 SLC26A1Q9H2B4 701 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 BOLA2Q9H3K6 86 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 HMG20AQ9NP66 347 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 G6PC2Q9NQR9 355 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 SLC38A7Q9NVC3 462 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 SEC14L4Q9UDX3 406 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 CIDEBQ9UHD4 219 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 HSF4Q9ULV5 492 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 HYOU1Q9Y4L1 999 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 MAU2Q9Y6X3 613 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 S4R3F8 94 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 TTC41PQ6P2S7 1318 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 GPRASP1Q5JY77 1395 aa-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 A0A1B0GTH9 108 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 A0A1B0GUA9 196 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 ILVBLA1L0T0 632 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 C9orf92A6NGG3 77 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 GLOD5A6NK44 160 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 SLC38A8A6NNN8 435 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 VGLL3A8MV65 326 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 FAM90A22PA8MWA6 464 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 A8MXE2 369 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 DEFB108AA8MXU0 73 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 CCER2I3L3R5 266 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 APAF1O14727 1248 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 MLNRO43193 412 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 TSPAN2O60636 221 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 TPPPO94811 219 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 MBD4O95243 580 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 FTCDO95954 541 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 IGHEP01854 428 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 ATP5G1P05496 136 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 GPIP06744 558 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 LDHCP07864 332 aa-1□□□□□ -2.57
SNORD57-201ENST00000448188 OR52Z1P0C646 297 aa-1□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms