RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MST1LQ2TV78 715 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP1ARQ63HQ0 302 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL24Q6TFL4 600 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMGN2P46Q86SG4 172 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XAGE5Q8WWM1 108 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB8BQ92930 207 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM45BQ96B21 275 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDIT4LQ96D03 193 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR14Q9BWN1 585 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOKQ9UQ07 419 aa11.51□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM72A0PK05 275 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP3D1O14617 1153 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF208O43345 1280 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RRP9O43818 475 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APEHP13798 732 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UQCRC2P22695 453 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KHKP50053 298 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNJ10P78508 379 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAXO2Q658L1 398 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD46Q86W74 232 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8J2Q8NGG1 315 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCP10LQ8TDR4 215 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C3orf49Q96BT1 292 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZG16BQ96DA0 208 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSGIN1Q9UJX0 560 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMED7Q9Y3B3 224 aa11.5□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCN2BO60939 215 aa11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPAG7O75391 227 aa11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERLIN1O75477 346 aa11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CARTPTQ16568 116 aa11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMU1Q2TAY7 513 aa11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPAT3Q53EU6 434 aa11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIKESHIQ53FT3 197 aa11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAQR6Q6TCH4 344 aa11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMM1Q92871 262 aa11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEURL3Q96EH8 262 aa11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OBP2BQ9NPH6 170 aa11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB21Q9UL25 225 aa11.49□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLDC2A0PJX2 215 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLF11O14901 512 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TACR3P29371 465 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CMIPQ8IY22 773 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKS4BQ8N8V4 417 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POMGNT2Q8NAT1 580 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR9K2Q8NGE7 335 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BOD1Q96IK1 185 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZIM3Q96PE6 472 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC38A2Q96QD8 506 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPY30Q9C005 99 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CA10Q9NS85 328 aa11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMGN4O00479 90 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAAHO00519 579 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDE5AO76074 875 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BPGMP07738 259 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT17P0C025 328 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF23P17027 643 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC1A3P43003 542 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP2K6P52564 334 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SQLEQ14534 574 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IQCCQ4KMZ1 466 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANXA8L1Q5VT79 327 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AAED1Q7RTV5 226 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA19Q7Z5L4 167 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS37AQ8NEZ2 397 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TESCQ96BS2 214 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R36Q96LQ0 422 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXN4Q96NZ1 517 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNS3Q9BQ31 491 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35A5Q9BS91 424 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KATNB1Q9BVA0 655 aa11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BPESC1Q9GZL8 116 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms