RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 RPS4Y2Q8TD47 263 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SNX33Q8WV41 574 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 THAP4Q8WY91 577 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 PTCHD1Q96NR3 888 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 DDOQ99489 341 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 OR10A5Q9H207 317 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 CHRDQ9H2X0 955 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 PTTG3PQ9NZH4 202 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 NLKQ9UBE8 527 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SPATA2Q9UM82 520 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 OR10H1Q9Y4A9 318 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 MMACHCQ9Y4U1 282 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 ALG5Q9Y673 324 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 TMEM131Q92545 1883 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 A0A0B4J293 547 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 A0A0G2JMP0 313 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 A0A0X1KG70 313 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 FITM1A5D6W6 292 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 HSPB2A8KAH6 182 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 E9PI62 339 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 I3L1I5 382 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 FZD7O75084 574 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 CT45A8P0DMV1 189 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 CT45A9P0DMV2 189 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 GRK6P43250 576 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 E2F1Q01094 437 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 TDGQ13569 410 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 INSL4Q14641 139 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 ELOCQ15369 112 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 HSPB2Q16082 182 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 CT45A2Q5DJT8 189 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 B3GLCTQ6Y288 498 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 CARFQ8N187 725 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 CADM2Q8N3J6 435 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 EID2Q8N6I1 236 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 BCORP1Q8N888 145 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 OR4M2Q8NGB6 313 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 RNF31Q96EP0 1072 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 RAB33BQ9H082 229 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 UBQLN4Q9NRR5 601 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 MALT1Q9UDY8 824 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 CAMK2AQ9UQM7 478 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SCN2AQ99250 2005 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 A8MU76 341 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 GLCEO94923 617 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 TACSTD2P09758 323 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 ARSBP15848 533 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 TYRP1P17643 537 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 RPL4P36578 427 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 CAPZBP47756 277 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 GZMKP49863 264 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 EFR3AQ14156 821 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 ANGPT1Q15389 498 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 PLA1AQ53H76 456 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 YIF1BQ5BJH7 314 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 NPSR1Q6W5P4 371 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 GKN2Q86XP6 184 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 SFTPA2Q8IWL1 248 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 ZNF615Q8N8J6 731 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 CYB561A3Q8NBI2 242 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 NPEPL1Q8NDH3 523 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 LILRB4Q8NHJ6 448 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 C16orf52Q8NHV5 167 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 ZFAND1Q8TCF1 268 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 C15orf40Q8WUR7 153 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 THRSPQ92748 146 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 PELI1Q96FA3 418 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 DPAGT1Q9H3H5 408 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 EMC3Q9P0I2 261 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 CACNG2Q9Y698 323 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 A0A1W2PPC1 479 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 ZNF217O75362 1048 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 TXNDC12O95881 172 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 EPXP11678 715 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 FAPQ12884 760 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 DYRK1AQ13627 763 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-203ENST00000402697 GPR176Q14439 515 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms