RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384525.1

RNU6-1117P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1117, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1117P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1117P-201ENST00000384525 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SDF4Q9BRK5 362 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SIAEQ9HAT2 523 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ACOXLQ9NUZ1 547 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NPIPA1Q9UND3 350 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FKBP7Q9Y680 259 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 WDR62O43379 1518 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PP2D1A8MPX8 630 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BTNL10A8MVZ5 291 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NME6O75414 186 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GNA14O95837 355 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 APCSP02743 223 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RLN1P04808 185 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NAMPTP43490 491 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GYG1P46976 350 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZP4Q12836 540 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PRMT9Q6P2P2 845 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TMPPEQ6ZT21 453 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MLKLQ8NB16 471 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 C10orf105Q8TEF2 133 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 WDR34Q96EX3 536 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 IP6K3Q96PC2 410 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SRMSQ9H3Y6 488 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CTPS2Q9NRF8 586 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CDH7Q9ULB5 785 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ENTPD4Q9Y227 616 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BUB1O43683 1085 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GAS8O95995 478 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ARL6IP1Q15041 203 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TTLL9Q3SXZ7 439 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CPTPQ5TA50 214 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LRRC38Q5VT99 294 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 AP1ARQ63HQ0 302 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 KRT80Q6KB66 452 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 C1orf186Q6ZWK4 172 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MIER3Q7Z3K6 550 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 UXS1Q8NBZ7 420 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LILRB4Q8NHJ6 448 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DNASE1L2Q92874 299 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SRD5A3Q9H8P0 318 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PASKQ96RG2 1323 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 A0A0U1RQV1 116 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 H7C417 338 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FCN1O00602 326 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BPY2O14599 106 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RP2O75695 350 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CNMDO75829 334 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CPA3P15088 417 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CAPN3P20807 821 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TFDP1Q14186 410 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 XKR7Q5GH72 579 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CYS1Q717R9 158 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 STRADAQ7RTN6 431 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NUP93Q8N1F7 819 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SVOPLQ8N434 492 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR2G3Q8NGZ4 309 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HIST1H2ACQ93077 130 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ADIPOR1Q96A54 375 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DEFB118Q96PH6 123 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CCT7Q99832 543 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TMEM246Q9BRR3 403 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LINC00597Q9H2U6 94 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ASF1BQ9NVP2 202 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZNF492Q9P255 531 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 C5AR2Q9P296 337 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GHRLQ9UBU3 117 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CBY1Q9Y3M2 126 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HTR3EA5X5Y0 456 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 JAK2O60674 1132 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CTAG2O75638 210 aa-1.34□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms