RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 LYPD4Q6UWN0 246 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RSC1A1Q92681 617 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 GHSRQ92847 366 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SNAPINO95295 136 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 F11P03951 625 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RPP30P78346 268 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MC2RQ01718 297 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 FAM26DQ5JW98 314 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ESX1Q8N693 406 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CUTCQ9NTM9 273 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PS29 197 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 NCR1O76036 304 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 HTR1FP30939 366 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TGFBR3Q03167 851 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 PHYHIPQ92561 330 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 PGAP2Q9UHJ9 254 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO7Q9Y3I1 522 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 UBR2Q8IWV8 1755 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 KLKB1P03952 638 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 GCH1P30793 250 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SSTR2P30874 369 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SLX4IPQ5VYV7 408 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 MMP21Q8N119 569 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SLC43A2Q8N370 569 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 GIMAP5Q96F15 307 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SLC41A2Q96JW4 573 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP23Q9BVJ7 150 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RPL35P42766 123 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN6P56747 220 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 XKR7Q5GH72 579 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SFXN4Q6P4A7 337 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFAF7Q7L592 441 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ANKLE1Q8NAG6 615 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA4GQ9NTN9 838 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 B3GNT2Q9NY97 397 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SERINC4A6NH21 518 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 YY2O15391 372 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 LIPCP11150 499 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 FPR3P25089 353 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CD38P28907 300 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 GDNFP39905 211 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TSFMP43897 325 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RAB4BP61018 213 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 GPR176Q14439 515 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM201Q5SNT2 666 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TBPL2Q6SJ96 375 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CHTF18Q8WVB6 975 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TM4SF18Q96CE8 201 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 OSGIN1Q9UJX0 560 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM82A0PJX8 343 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TAPBPO15533 448 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 AQP9O43315 295 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 Q499Y3 187 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 KDM4DQ6B0I6 523 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 AMDHD1Q96NU7 426 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF136P52737 540 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 COX15Q7KZN9 410 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 FAM109AQ8N4B1 249 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF454Q8N9F8 522 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD4Q8TB40 342 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ARRDC3Q96B67 414 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ULBP2Q9BZM5 246 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ACOD1A6NK06 481 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SLC43A1O75387 559 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 C14orf28Q4W4Y0 310 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 NAT6Q93015 286 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF681Q96N22 645 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 ENKD1Q9H0I2 346 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RGPD2P0DJD1 1756 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A23A1A5C7 686 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 CHATP28329 748 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 DYRK1AQ13627 763 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 NR0B2Q15466 257 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RFLNAQ6ZTI6 216 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 OR4K15Q8NH41 348 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 RLIMQ9NVW2 624 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 EHFQ9NZC4 300 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 HCSTQ9UBK5 93 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-201ENST00000284617 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms