RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 FGD3Q5JSP0 725 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 VASNQ6EMK4 673 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 OR5M9Q8NGP3 310 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 SLC7A13Q8TCU3 470 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 ALPK1Q96QP1 1244 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 H3BML4 177 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF208O43345 1280 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 IST1P53990 364 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 DAG1Q14118 895 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 DCST1Q5T197 706 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 PODNL1Q6PEZ8 512 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM255BQ8WV15 326 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 HS6ST2Q96MM7 605 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 TIMP4Q99727 224 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM43Q9BTV4 400 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 SERINC1Q9NRX5 453 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 USE1Q9NZ43 259 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 CAMK2AQ9UQM7 478 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF337Q9Y3M9 751 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 U3KQV3 271 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 A0A087WUU8 490 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 CCNA2P20248 432 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 EGR4Q05215 589 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 SEC23BQ15437 767 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 C3AR1Q16581 482 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 GXYLT1Q4G148 440 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 C3orf33Q6P1S2 294 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 PM20D2Q8IYS1 436 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM239Q8WW34 195 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 SMPDL3BQ92485 455 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 RDH12Q96NR8 316 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 PNPLA3Q9NST1 481 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 ALKBH4Q9NXW9 302 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 TINAGQ9UJW2 476 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 TMCC3Q9ULS5 477 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
HOXD11-201ENST00000249504 SH3PXD2BA1X283 911 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 FIGNL2A6NMB9 653 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 A8MVM7 634 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 NPIPB7O75200 414 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 STSP08842 583 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 PEPDP12955 493 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 STARP49675 285 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 UGT2B15P54855 530 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 RAC1P63000 192 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 C1QL3Q5VWW1 255 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 STK35Q8TDR2 534 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 SLC19A3Q9BZV2 496 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 ORC6Q9Y5N6 252 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 AP4B1Q9Y6B7 739 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 DENRO43583 198 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 ALPLP05186 524 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 CA7P43166 264 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 SRYQ05066 204 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 MED21Q13503 144 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 RFX4Q33E94 735 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF585AQ6P3V2 769 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 TBPL2Q6SJ96 375 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF730Q6ZMV8 503 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 WDYHV1Q96HA8 205 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 PRDM14Q9GZV8 571 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 SEC14L5O43304 696 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 PTNP21246 168 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 CLK1P49759 484 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 LHX2P50458 406 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 PPP2R2BQ00005 443 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 MICAQ29983 383 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 SYT14P1Q58G82 188 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 C5orf46Q6UWT4 87 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 DOLPP1Q86YN1 238 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 P3H2Q8IVL5 708 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 UBQLNLQ8IYU4 475 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00471Q8N535 108 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 MEIOBQ8N635 442 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD11-201ENST00000249504 OR4K5Q8NGD3 323 aa17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms