RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 KDM8Q8N371 416 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 PHYHIPQ92561 330 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SURF4O15260 269 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR8U8P0C7N1 319 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 HNF1AP20823 631 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SLC35A2P78381 396 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 MED17Q9NVC6 651 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SCML1Q9UN30 329 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 PHLPP1O60346 1717 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 AIFM1O95831 613 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 FAM166BA8MTA8 275 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 GSRP00390 522 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 GBAP04062 536 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 STAG3L3P0CL85 134 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TGM1P22735 817 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TAS2R38P59533 333 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DCAF4L2Q8NA75 395 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 NPY6RQ99463 290 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ST8SIA5O15466 376 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 BAK1Q16611 211 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 AMZ1Q400G9 498 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 COPS3Q9UNS2 423 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM212A6NML5 194 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ASGR2P07307 311 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 KCNQ1P51787 676 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 P2RY14Q15391 338 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 FIBINQ8TAL6 211 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 IL21RQ9HBE5 538 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ATP1B3P54709 279 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 NRLP54845 237 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ACY1Q03154 408 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF154Q13106 437 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SAMD8Q96LT4 415 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ZPBPQ9BS86 351 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 FOLR1P15328 257 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 KCNE1P15382 129 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SORDQ00796 357 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 MAP3K3Q99759 626 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RNF208Q9H0X6 261 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJC13O75165 2243 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 M0QZK8 103 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ACPPP15309 386 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 HSF1Q00613 529 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SERTAD2Q14140 314 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM107Q6UX40 140 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR6V1Q8N148 313 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SLC5A8Q8N695 610 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.55□□□□□ -1.36
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