RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 AP1ARQ63HQ0 302 aa10.25□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 STK32CQ86UX6 486 aa10.25□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ADGRG3Q86Y34 549 aa10.25□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 PTOV1Q86YD1 416 aa10.25□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 SMYD1Q8NB12 490 aa10.25□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ELOA3Q8NG57 546 aa10.25□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 OR6K3Q8NGY3 331 aa10.25□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 STARD4Q96DR4 205 aa10.25□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 GLRX2Q9NS18 164 aa10.25□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 SELENONQ9NZV5 590 aa10.25□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 MSTNO14793 375 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 TPST1O60507 370 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 PRKD3O94806 890 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 POU2F1P14859 743 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 DRD4P21917 467 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 AGTR1P30556 359 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 PCGF2P35227 344 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 PEX19P40855 299 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 NUDT2P50583 147 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 RAC3P60763 192 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 RBBP4Q09028 425 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 BNIP2Q12982 314 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ADRM1Q16186 407 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 TMPPEQ6ZT21 453 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC30A8Q8IWU4 369 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 TUSC5Q8IXB3 177 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 OR8J3Q8NGG0 315 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 OR52E4Q8NGH9 312 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC01560Q8TB33 94 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF128Q8TEB7 428 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ARL5BQ96KC2 179 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 TAPBPLQ9BX59 468 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 KLHL4Q9C0H6 718 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ADPRHL2Q9NX46 363 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 CRIM1Q9NZV1 1036 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 KLHL9Q9P2J3 617 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 KLHL13Q9P2N7 655 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 GMEB1Q9Y692 573 aa10.24□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 CCT8L1PA6NM43 557 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 FXYD1O00168 92 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 FAAHO00519 579 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 SNX3O60493 162 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 NPPAP01160 153 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 IGFBP2P18065 325 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 KLK2P20151 261 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 IDUAP35475 653 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 CD79BP40259 229 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC35A1P78382 337 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 DMTNQ08495 405 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 OR7A5Q15622 319 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 VMACQ2NL98 169 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ALKBH2Q6NS38 261 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC43A2Q8N370 569 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF610Q8N9Z0 462 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 MED18Q9BUE0 208 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 FANCFQ9NPI8 374 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 JKAMPQ9P055 326 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 EMC3Q9P0I2 261 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM181Q9P2C4 612 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 KCNN3Q9UGI6 736 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 CHST2Q9Y4C5 530 aa10.23□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ITPR2Q14571 2701 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 A8MXE2 369 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 M0QX08 132 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 M0R3H8 397 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 CASKO14936 926 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 GSTA4O15217 222 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF208O43345 1280 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 AHSA1O95433 338 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 PMS2P2O95744 297 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 GPIP06744 558 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 YES1P07947 543 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 CD8BP10966 210 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 PTNP21246 168 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 CLK1P49759 484 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM27E3Q08E93 113 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ERICH5Q6P6B1 374 aa10.22□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms