RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 CD1CP29017 333 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 CD86P42081 329 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 KIR3DL2P43630 455 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 RGS19P49795 217 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 STC1P52823 247 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R43P59537 309 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 HSD11B2P80365 405 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 FABP5Q01469 135 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 TLE2Q04725 743 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 LTBP2Q14767 1821 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 NR0B2Q15466 257 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 AARDQ4LEZ3 155 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 XKR6Q5GH73 641 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 DOK6Q6PKX4 331 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 NDUFAF7Q7L592 441 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 SIAH3Q8IW03 269 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 TET1Q8NFU7 2136 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 OR4K15Q8NH41 348 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 THEM6Q8WUY1 208 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 RSC1A1Q92681 617 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 TMEM203Q969S6 136 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 TADA1Q96BN2 335 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 C3orf49Q96BT1 292 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 HPDLQ96IR7 371 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 EGFL8Q99944 293 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 MGME1Q9BQP7 344 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 FZD8Q9H461 694 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 ACER3Q9NUN7 267 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 GALPQ9UBC7 116 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 DHRS7Q9Y394 339 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 KPTNQ9Y664 436 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 SCN5AQ14524 2016 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 NUP205Q92621 2012 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 A0A087X0M5 115 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GX30 115 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 BTBD17A6NE02 478 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 UNC119BA6NIH7 251 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 ITGB1BP1O14713 200 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 FFAR3O14843 346 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 PGRMC2O15173 223 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 GPR42O15529 346 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 OIP5O43482 229 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 BEST1O76090 585 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 NDUFB6O95139 128 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 RAB3DO95716 219 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 HPXP02790 462 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 OR8U8P0C7N1 319 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 MYOGP15173 224 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 HLA-GP17693 338 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 HLA-DPA1P20036 260 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 IDSP22304 550 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 THBS2P35442 1172 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-211ENST00000481115 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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