RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466274.1

NCL-208, Transcript of nucleolin, human

TSL 2

Gene NCL, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCL-208	ENST00000466274	PCNA	P12004	261 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CPM	P14384	443 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	S1PR1	P21453	382 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SLC1A2	P43004	574 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ATP4B	P51164	291 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PRPS1	P60891	318 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	LMO4	P61968	165 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PHEX	P78562	749 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CDK16	Q00536	496 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	IRF8	Q02556	426 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ADIPOQ	Q15848	244 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	AADACL2	Q6P093	401 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ZNF529	Q6P280	563 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MED27	Q6P2C8	311 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	RDH5	Q92781	318 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	WDR34	Q96EX3	536 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ARL5B	Q96KC2	179 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MUS81	Q96NY9	551 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	BBS4	Q96RK4	519 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	OR51B5	Q9H339	312 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ASB6	Q9NWX5	421 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	EMC3	Q9P0I2	261 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PSME2	Q9UL46	239 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	TFR2	Q9UP52	801 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	VDAC3	Q9Y277	283 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ASB4	Q9Y574	426 aa		5	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274		B4DXG7	233 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CCDC188	H7C350	402 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PGRMC2	O15173	223 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	LIAS	O43766	372 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SH3BGRL	O75368	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	EED	O75530	441 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CLPX	O76031	633 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CLDN9	O95484	217 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ATP1B1	P05026	303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	NPR2	P20594	1047 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	VPS41	P49754	854 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	EMD	P50402	254 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SESN3	P58005	492 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	TBCC	Q15814	346 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CCNG2	Q16589	344 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	STX1A	Q16623	288 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PDK4	Q16654	411 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	APH1A	Q96BI3	265 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	DOK1	Q99704	481 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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