RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.46□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 ULBP2Q9BZM5 246 aa8.46□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 SLC22A11Q9NSA0 550 aa8.46□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.46□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
DDX39B-215ENST00000462256 M0R3H8 397 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 WDR1O75083 606 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SNAPC1Q16533 368 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PAGE3Q5JUK9 113 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 C1QL3Q5VWW1 255 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 COX15Q7KZN9 410 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 OR2L13Q8N349 312 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF321PQ8N8H1 164 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 LAT2Q9GZY6 243 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SCN3BQ9NY72 215 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF225Q9UK10 706 aa8.46□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 A8MVM7 634 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TNFRSF21O75509 655 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NKX2-2O95096 273 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CBX7O95931 251 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CHRM4P08173 479 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ARAFP10398 606 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 BICRALQ6AI39 1079 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PROKR2Q8NFJ6 384 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 RHCGQ9UBD6 479 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ROS1P08922 2347 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1W2PNR3 127 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF195O14628 629 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 VAMP5O95183 116 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ACP2P11117 423 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PRPH2P23942 346 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 MAJINQ3KP22 176 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 STX19Q8N4C7 294 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 HPS1Q92902 700 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 IMMP1LQ96LU5 166 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 RNF32Q9H0A6 362 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 FTCDNL1E5RQL4 147 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SOCS6O14544 535 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ARHGEF9O43307 516 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 WNT11O96014 354 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 HMGN1P05114 100 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NID1P14543 1247 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF12P17014 697 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 GSTM3P21266 225 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ESRRGP62508 458 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CTAG1AP78358 180 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 COX10Q12887 443 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NDUFA5Q16718 116 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 NIPAL3Q6P499 406 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 C9orf40Q8IXQ3 194 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 OR4C3Q8NH37 302 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZFP90Q8TF47 636 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 HES7Q9BYE0 225 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 HRKO00198 91 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 FBXO45P0C2W1 286 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SMIM10L1P0DMW3 83 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 GXYLT1Q4G148 440 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF721Q8TF20 911 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SMIM10Q96HG1 83 aa8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 KIF26BQ2KJY2 2108 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 FUT1P19526 365 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TBXA2RP21731 343 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 PCGF2P35227 344 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 CTXN1P60606 82 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 TUBA4AP68366 448 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 MYBPC1Q00872 1141 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 SYT14P1Q58G82 188 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 FCRLAQ7L513 359 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.44□□□□□ -1.06
DDX39B-215ENST00000462256 LNX2Q8N448 690 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms