RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	ST8SIA1	Q92185	356 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	MUCL1	Q96DR8	90 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	NSL1	Q96IY1	281 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ALG2	Q9H553	416 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SERINC4	A6NH21	518 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	OVOL3	O00110	214 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	OIP5	O43482	229 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	STX11	O75558	287 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	KRT75	O95678	551 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	AGR2	O95994	175 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	MATN1	P21941	496 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	OR3A2	P47893	321 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	NUDT2	P50583	147 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	MNAT1	P51948	309 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	DMTN	Q08495	405 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	TNK1	Q13470	666 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	TSC22D1	Q15714	1073 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	DPP10	Q8N608	796 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	OR5B2	Q96R09	309 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SDF2	Q99470	211 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	PSD2	Q9BQI7	771 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	LAT2	Q9GZY6	243 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	OR51I1	Q9H343	314 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	EXD2	Q9NVH0	621 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	DNHD1	Q96M86	4753 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	USF3	Q68DE3	2245 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A1W2PNR3	127 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF724	A8MTY0	619 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CYTIP	O60759	359 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CYP7B1	O75881	506 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	UBOX5	O94941	541 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	PGC	P20142	388 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	BSPH1	Q075Z2	132 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	PPA1	Q15181	289 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	GPR68	Q15743	365 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	STK11	Q15831	433 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	NEURL3	Q96EH8	262 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	EMC3	Q9P0I2	261 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	EVPLL	A8MZ36	301 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CLIC1	O00299	241 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	EBAG9	O00559	213 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CSTA	P01040	98 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SOD3	P08294	240 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	DANCR	P0C864	163 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	GGT1	P19440	569 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	CALB2	P22676	271 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	MVD	P53602	400 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	PLAUR	Q03405	335 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	SKP2	Q13309	424 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF141	Q15928	474 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	COX20	Q5RI15	118 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	RAB8B	Q92930	207 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	ROPN1L	Q96C74	230 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	LRRC58	Q96CX6	371 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SNHG11-208	ENST00000437028	RADIL	Q96JH8	1075 aa		13.66	□□□□□ -0.22

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