RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 HACD4Q5VWC8 232 aa14.24□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.24□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.24□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 PELI2Q9HAT8 420 aa14.24□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 WDR45Q9Y484 360 aa14.24□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa14.24□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 RNF215Q9Y6U7 377 aa14.24□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 PLXNA2O75051 1894 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 CBX7O95931 251 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 ADH1CP00326 375 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 PCCBP05166 539 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 EDNRAP25101 427 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 TMUB2Q71RG4 321 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF614Q8N883 585 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 SDR9C7Q8NEX9 313 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 OTUB2Q96DC9 234 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 DPEP2Q9H4A9 486 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 IGFLR1Q9H665 355 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 DEC1Q9P2X7 70 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 CACNA1CQ13936 2221 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 SC5DO75845 299 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 RLN1P04808 185 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 ATP1B1P05026 303 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 DYRK1AQ13627 763 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 MLC1Q15049 377 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 OR7G2Q8NG99 324 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 OR4K13Q8NH42 304 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM239Q8WW34 195 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 PEX12O00623 359 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 STX11O75558 287 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 MPIP34949 423 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 ERVK-21P61565 698 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 CMIPQ8IY22 773 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 OR4C6Q8NH72 309 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 WASH6PQ9NQA3 447 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 ABRACLQ9P1F3 81 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 TGM6O95932 706 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 NT5EP21589 574 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF136P52737 540 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 OR1Q1Q15612 314 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 SNX33Q8WV41 574 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 PELI1Q96FA3 418 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 RP2O75695 350 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 KRT33AO76009 404 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF35P13682 527 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 S100A11P31949 105 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 RAG2P55895 527 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 BTN3A2P78410 334 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF234Q14588 700 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 GXYLT1Q4G148 440 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 GJD3Q8N144 294 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 OR52E2Q8NGJ4 325 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 FGF13Q92913 245 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 GFI1Q99684 422 aa14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 ALPK2Q86TB3 2170 aa14.21□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 SPEGQ15772 3267 aa14.21□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 OR6C74A6NCV1 312 aa14.21□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 FAM74A7A6NL05 159 aa14.21□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.21□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.21□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 PRKAR1BP31321 381 aa14.21□□□□□ -0.13
SFRP4-201ENST00000436072 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.8 ms