RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 J3QLW9 94 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 TNFRSF10AO00220 468 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 CLDN4O14493 209 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ARPC3O15145 178 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 GATBO75879 557 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 PSKH1P11801 424 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 TDGF1P13385 188 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ZNF19P17023 458 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 PITPNBP48739 271 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 SLC16A1P53985 500 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 FZD2Q14332 565 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 CCDC58Q4VC31 144 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 BICRALQ6AI39 1079 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 PYHIN1Q6K0P9 492 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 OR6C4Q8NGE1 309 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 RLN3Q8WXF3 142 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ART5Q96L15 291 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 SLA2Q9H6Q3 261 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 TMEM165Q9HC07 324 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 A0A087WUJ7 227 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 A0A1B0GTQ1 180 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 NGFRP08138 427 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 CTSEP14091 401 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 E2F1Q01094 437 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 HSF2Q03933 536 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 STX4Q12846 297 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 IL10RAQ13651 578 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 CMTM3Q96MX0 182 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 PTCHD1Q96NR3 888 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 NIPAL2Q9H841 368 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 UCK1Q9HA47 277 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ABRACLQ9P1F3 81 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 MALT1Q9UDY8 824 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 LAMA1P25391 3075 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 FRYLO94915 3013 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-205ENST00000409985 ZNF749O43361 778 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ADAM11O75078 769 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ARL6IP5O75915 188 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 NSA2O95478 260 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ERP29P30040 261 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 GPR3P46089 330 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 OR12D2P58182 307 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 FUT7Q11130 342 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 CDONQ4KMG0 1287 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ACSM3Q53FZ2 586 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 TCTN2Q96GX1 697 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ZNF285Q96NJ3 590 aa21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 DVL2O14641 736 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 FOXS1O43638 330 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 SLC6A1P30531 599 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ADH7P40394 386 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 SHISA5Q8N114 240 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ZNF614Q8N883 585 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 RCBTB1Q8NDN9 531 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 RFT1Q96AA3 541 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 STARD5Q9NSY2 213 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 RASD1Q9Y272 281 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 A0A0G2JMP0 313 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 A0A0X1KG70 313 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 HCRTR1O43613 425 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 DIO1P49895 249 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 SLC3A1Q07837 685 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 KIRREL2Q6UWL6 708 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 OR4M2Q8NGB6 313 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 OR52E2Q8NGJ4 325 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 OR14A16Q8NHC5 309 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 UBASH3BQ8TF42 649 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 GHSRQ92847 366 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 TRIM63Q969Q1 353 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 SMIM19Q96E16 107 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 DGAT2Q96PD7 388 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 NLKQ9UBE8 527 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ZNF337Q9Y3M9 751 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ALG5Q9Y673 324 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 SERINC4A6NH21 518 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 THEGLP0DJG4 465 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 CLUP10909 449 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms