RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 MASP1P48740 699 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 MLLT10P55197 1068 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 CDH15P55291 814 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 CDK5Q00535 292 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 OAFQ86UD1 273 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 SETD9Q8NE22 299 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 TEX47Q8TBZ9 253 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 KCNE4Q8WWG9 221 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 ST8SIA1Q92185 356 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 TAAR8Q969N4 342 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 IL4I1Q96RQ9 567 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 TSSK6Q9BXA6 273 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 OR52D1Q9H346 318 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 TBC1D23Q9NUY8 699 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 CDH10Q9Y6N8 788 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 SNPHO15079 494 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 PTP4A3O75365 173 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 CCL11P51671 97 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 DEFB109BQ30KR1 87 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 C6orf141Q5SZD1 244 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 C12orf73Q69YU5 71 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 TMEM234Q8WY98 164 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 RHNO1Q9BSD3 238 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 ADNPQ9H2P0 1102 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 C12orf10Q9HB07 376 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 MCCC2Q9HCC0 563 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 SACM1LQ9NTJ5 587 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 MYRFQ9Y2G1 1151 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD33BA6NCL7 494 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 XPNPEP2O43895 674 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 TNFAIP8O95379 198 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 GABRB1P18505 474 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 RRADP55042 308 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 OR1C1Q15619 314 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 ZNF74Q16587 644 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 BROXQ5VW32 411 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 TIGD3Q6B0B8 471 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 C10orf53Q8N6V4 93 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 OR1J4Q8NGS1 313 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 SLC19A3Q9BZV2 496 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 IMPAD1Q9NX62 359 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 TVP23BQ9NYZ1 205 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 OPN1LWP04000 364 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 NUP107P57740 925 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 CDC42P60953 191 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 SLC27A4Q6P1M0 643 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 TMEM154Q6P9G4 183 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 RHOXF1Q8NHV9 184 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 AGAP4Q96P64 663 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 PTDSS2Q9BVG9 487 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 ZNF696Q9H7X3 374 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 SEC14L4Q9UDX3 406 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 POLHQ9Y253 713 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 PRKYO43930 277 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 NPIPB7O75200 414 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 SLC25A12O75746 678 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 OR7A10O76100 309 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 RFPL3SP0C7P2 107 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 SMIM18P0DKX4 95 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 IGFN1Q86VF2 1251 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 FDCSPQ8NFU4 85 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 OSTF1Q92882 214 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 ARL5BQ96KC2 179 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 UBQLN3Q9H347 655 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 TMEM185BQ9H7F4 350 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 KLHL1Q9NR64 748 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 GPR52Q9Y2T5 361 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 LRRC3CA6NJW4 275 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 SNX4O95219 450 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 SOX8P57073 446 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 C19orf57Q0VDD7 668 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 ZBED5Q49AG3 693 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 SMARCD3Q6STE5 483 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 PTCHD4Q6ZW05 846 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 TCEANCQ8N8B7 351 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 TMEM41AQ96HV5 264 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 PTGES2Q9H7Z7 377 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 SLC25A19Q9HC21 320 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 HHATLQ9HCP6 504 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-202ENST00000405333 AMBNQ9NP70 447 aa18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms