RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SARGQ9BW04 601 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 BEX2Q9BXY8 128 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 CBLCQ9ULV8 474 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TERTO14746 1132 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPIND1P05546 499 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS18P62269 152 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNJQ5T5M9 372 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TRILQ7L0X0 811 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SYT14Q8NB59 555 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6T1Q8NGN1 323 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 NEIL3Q8TAT5 605 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 WFDC6Q9BQY6 131 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ENAMQ9NRM1 1142 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 LIPT1Q9Y234 373 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVH48-1M5A8F1 160 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHA1P01876 353 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ARSBP15848 533 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SSTR4P31391 388 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 DLSTP36957 453 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP12AP54707 1039 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CDH11P55287 796 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 MANEAQ5SRI9 462 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CADM2Q8N3J6 435 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 FAIM2Q9BWQ8 316 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 AICDAQ9GZX7 198 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNN2Q9H2S1 579 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPC4Q9UBN4 977 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CDH10Q9Y6N8 788 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFS4O43181 175 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ARFIP1P53367 373 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ASPGQ86U10 573 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 LRFN5Q96NI6 719 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 GPA33Q99795 319 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 RERGLQ9H628 205 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 PTTG3PQ9NZH4 202 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 NLKQ9UBE8 527 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRPO00591 440 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 NTSP30990 170 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 PAMR1Q6UXH9 720 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SNAPC3Q92966 411 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 AMDHD1Q96NU7 426 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL31Q9H511 634 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNA1GO43497 2377 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXS1O43638 330 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 HK1P19367 917 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 MTNR1BP49286 362 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ST3GAL3Q11203 375 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 AADACL4Q5VUY2 407 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM198BQ6UWH4 519 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGXQ8TBF5 258 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 MARVELD3Q96A59 401 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 UPRTQ96BW1 309 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CALML5Q9NZT1 146 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SRPK3Q9UPE1 567 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SCN2AQ99250 2005 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087WUU8 490 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GX78 115 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 C4orf51C9J302 202 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 RTCAO00442 366 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R41P59536 307 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM180BQ6P0A1 224 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 RRM2BQ7LG56 351 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 GHDCQ8N2G8 530 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2J2Q8N2K1 259 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM109AQ8N4B1 249 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 GLIPR2Q9H4G4 154 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 EGLN3Q9H6Z9 239 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC13A4Q9UKG4 626 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 I3L1I5 382 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CD53P19397 219 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 HTR1FP30939 366 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 OR3A3P47888 321 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 P2RY14Q15391 338 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 BTBD16Q32M84 506 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 COX15Q7KZN9 410 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 COMTD1Q86VU5 262 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TTLQ8NG68 377 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 OR56A1Q8NGH5 318 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGDIGQ99819 225 aa24.16■■□□□ 1.46
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