RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa20.39■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CHRNA9Q9UGM1 479 aa20.39■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SPEF1Q9Y4P9 236 aa20.39■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 WASP42768 502 aa20.38■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 HDDC2Q7Z4H3 204 aa20.38■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF671Q8TAW3 534 aa20.38■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 COMMD7Q86VX2 200 aa20.38■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 OR2T35Q8NGX2 323 aa20.38■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 ENPP2Q13822 863 aa20.37■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 MTFR2Q6P444 385 aa20.37■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 IZUMO1Q8IYV9 350 aa20.37■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 IL23AQ9NPF7 189 aa20.37■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 GMDSO60547 372 aa20.37■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.37■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20.37■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 IL21RQ9HBE5 538 aa20.37■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 AANATQ16613 207 aa20.36■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa20.36■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 ARSGQ96EG1 525 aa20.36■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 MYADMQ96S97 322 aa20.36■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 FGF22Q9HCT0 170 aa20.36■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 CTSVO60911 334 aa20.36■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 EML2O95834 649 aa20.36■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 EID2Q8N6I1 236 aa20.36■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SDR9C7Q8NEX9 313 aa20.36■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 OR14A16Q8NHC5 309 aa20.36■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 GFI1Q99684 422 aa20.36■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 TWSG1Q9GZX9 223 aa20.36■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 RCE1Q9Y256 329 aa20.36■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 FKBP7Q9Y680 259 aa20.36■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa20.35■□□□□ 0.85
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF250P15622 560 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SRMP19623 302 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SDHBP21912 280 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 GABRA3P34903 492 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 GJA4P35212 333 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 MFSD13AQ14CX5 517 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 LINC00114Q6XXX2 140 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 ZAR1Q86SH2 424 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 OR4K13Q8NH42 304 aa20.35■□□□□ 0.85
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