RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 GNA13Q14344 377 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 BTN2A1Q7KYR7 527 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 RADILQ96JH8 1075 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF649Q9BS31 505 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 LIN7BQ9HAP6 207 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 TBX21Q9UL17 535 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 PRNPP04156 253 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ADRB3P13945 408 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ACHEP22303 614 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 C2orf68Q2NKX9 166 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 OR11G2Q8NGC1 345 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 TTC9Q92623 222 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 SEC22AQ96IW7 307 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 NMNAT3Q96T66 252 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 TVP23AA6NH52 213 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 IL9P15248 144 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 STPG1Q5TH74 334 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 FAM122CQ6P4D5 195 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 FAM219AQ8IW50 185 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 PPM1BO75688 479 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 PLA2G7Q13093 441 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 HDDC2Q7Z4H3 204 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 LINC00471Q8N535 108 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 IL21RQ9HBE5 538 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 CLDND1Q9NY35 253 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 LILRB5O75023 590 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 SULT1A3P0DMM9 295 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 SULT1A4P0DMN0 295 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 GABRA3P34903 492 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 FXYD6P3P58550 94 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ERVK-21P61565 698 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 PITPNAQ00169 270 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF85Q03923 595 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 OR56A1Q8NGH5 318 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 MRGPRX3Q96LB0 322 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 GPR160Q9UJ42 338 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 POMT2Q9UKY4 750 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 MED31Q9Y3C7 131 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ASB4Q9Y574 426 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 TRIOO75962 3097 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 OR8G3PP0DMU2 310 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF3P17036 446 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 GID4Q8IVV7 300 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 FCAMRQ8WWV6 532 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM74BQ9NUR3 256 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CTDP1-201ENST00000075430 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 A0A0G2JK05 382 aa15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 TOR1AO14656 332 aa15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ADH1CP00326 375 aa15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 HTR2AP28223 471 aa15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 PGDP52209 483 aa15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 PCGF3Q3KNV8 242 aa15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 LRRN1Q6UXK5 716 aa15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ZAR1Q86SH2 424 aa15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 DUSP19Q8WTR2 217 aa15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 FGF11Q92914 225 aa15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 MARC2Q969Z3 335 aa15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 LMF1Q96S06 567 aa15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 CCSO14618 274 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 RP2O75695 350 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 KRT33AO76009 404 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 CFL1P23528 166 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 OR4D10Q8NGI6 311 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 MS4A6EQ96DS6 147 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 TIMP4Q99727 224 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 TRIM77I1YAP6 450 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 CASC3O15234 703 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 IGHA1P01876 353 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDP1-201ENST00000075430 IFNA16P05015 189 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 162.3 ms