RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prmt3Q922H1 532 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd302Q9DCG2 228 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MNCb-2990Q9JJ93 142 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm15155B1B034 138 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sh3yl1O08641 340 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem165P52875 323 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tle3Q08122 772 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 UbqlnlQ14DL0 610 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Diras2Q5PR73 199 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nyap2Q8BM65 682 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem163Q8C996 288 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PiguQ8K358 434 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8R2K8 148 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ntng1Q8R4G0 539 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnfsf13Q9D777 241 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chp2Q9D869 196 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1025-ps1A0A140T8K3 312 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata31d1cE9QAF1 853 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9493F6SVV1 192 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dscr3O35075 297 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FxnO35943 207 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itga5P11688 1053 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmd7P26516 321 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdh11P55288 796 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Col10a1Q05306 680 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klri2Q5DT36 248 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Obp1aQ9D3H2 163 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nxt1Q9QZV9 140 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc22a21Q9WTN6 564 aa11.95□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A0A286YD13 301 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r42O35192 852 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nmur1O55040 428 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gfi1P70338 423 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BmxP97504 651 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BadQ61337 204 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr714Q7TRN0 317 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc5a8Q8BYF6 611 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r210Q8R274 306 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FastkQ9JIX9 511 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc6a14Q9JMA9 638 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adam25Q9R159 760 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 2610044O15Rik8A0A087WRJ1 410 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lilra6A0A0B4J1F3 663 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zar1lC3VD30 291 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gon7P0C8B4 98 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RpiaP47968 303 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tead3P70210 439 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adam5Q3TTE0 751 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnft2Q3UF64 445 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mc2rQ64326 296 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DmknQ6P253 517 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ncs1Q8BNY6 190 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bmt2Q8BXK4 403 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ikzf4Q8C208 586 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8C3I9 435 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc16a14Q8K1C7 512 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CcsapQ8QZT2 252 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1395Q8VGD7 317 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrch4Q921G6 680 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddx28Q9CWT6 540 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Elovl4Q9EQC4 312 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TriobpQ99KW3 2014 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf296E9Q6W4 445 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsd3b3P26150 373 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rfx3P48381 749 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 InipQ3TXT3 104 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slitrk4Q810B8 837 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gykl1Q8C635 549 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr583Q8VG25 319 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chrm5Q920H4 532 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psg23Q9D2U0 471 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam69aQ9D6I7 428 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psg21Q9DAV5 471 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Brix1Q9DCA5 353 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr937Q9EQB4 311 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chrm3Q9ERZ3 589 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myg1Q9JK81 380 aa11.94□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm13539A0A1B0GSM6 183 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Macc1E9PXX8 851 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r106E9PY92 862 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp59P16373 634 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc19a1P41438 512 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Crabp1P62965 137 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Agbl5Q09M02 886 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pdp1Q3UV70 538 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Amz2Q400C8 359 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr298Q7TS06 332 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fads6Q80UG1 342 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr854Q8VFF1 315 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr676Q8VGZ9 317 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc46a3Q9DC26 460 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 2410141K09RikK7N769 464 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sox18P43680 377 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fgf14P70379 247 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ebf1Q07802 591 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dmrtc1bQ2PMX6 267 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fmr1nbQ80ZA7 238 aa11.93□□□□□ -0.5
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf26Q8BUH7 424 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.6 ms