RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641321.1

CASC19-222, Transcript of cancer susceptibility 19, human

BASIC

Gene CASC19, Length 1,173 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-222	ENST00000641321	FTCD	O95954	541 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	ACTL6A	O96019	429 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	FGF4	P08620	206 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	DANCR	P0C864	163 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	CCL3	P10147	92 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	ERG	P11308	486 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	TBXA2R	P21731	343 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	ADRA1D	P25100	572 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	RBL1	P28749	1068 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	SERPINF1	P36955	418 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	MAGEA4	P43358	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	SLC6A12	P48065	614 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	CAMLG	P49069	296 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	GPR143	P51810	404 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	RCN2	Q14257	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	AANAT	Q16613	207 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	MED29	Q9NX70	200 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	TAC3	Q9UHF0	121 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321		A0A1W2PNV4	684 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321		H0Y8G0	127 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	CHST10	O43529	356 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	CLN5	O75503	358 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	TNFSF13	O75888	250 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	OTC	P00480	354 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	TGFA	P01135	160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	C1QA	P02745	245 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	HPN	P05981	417 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	SOD3	P08294	240 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	ALOX5	P09917	674 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	UBL4A	P11441	157 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	CPN1	P15169	458 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	MAOA	P21397	527 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	IL32	P24001	234 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65	2e-7	■■□□□ 13.2
CASC19-222	ENST00000641321	DPP4	P27487	766 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	PTPN6	P29350	595 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	CCR7	P32248	378 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	GRK5	P34947	590 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	GJC1	P36383	396 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	PIGA	P37287	484 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	HTR2B	P41595	481 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	CBX5	P45973	191 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	BDKRB1	P46663	353 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	HSPA13	P48723	471 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	STAR	P49675	285 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	CCR8	P51685	355 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	PPP5C	P53041	499 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	PRRX1	P54821	245 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	TSPAN5	P62079	268 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	CASP8	Q14790	479 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	KRT31	Q15323	416 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	XKR6	Q5GH73	641 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-222	ENST00000641321	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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