RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628516.1

LINC00628-201, long intergenic non-protein coding RNA 628, humanhuman

BASIC

Gene LINC00628, Length 1,289 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00628-201ENST00000628516 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 ROS1P08922 2347 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 A0A1W2PP18 115 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 KIAA0513O60268 411 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 DNAJA2O60884 412 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 H6PDO95479 791 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 PLAUP00749 431 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 IL32P24001 234 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 KHKP50053 298 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 MERTKQ12866 999 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 KLF10Q13118 480 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 PAGE3Q5JUK9 113 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 ROPN1LQ96C74 230 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 PSD2Q9BQI7 771 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 POLE3Q9NRF9 147 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 ARMCX1Q9P291 453 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 DSCAMO60469 2012 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 A0A096LPI6 279 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 CCDC22O60826 627 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 ADAP00813 363 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 GUSBP08236 651 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 ZCCHC18P0CG32 403 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 RYKP34925 604 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 PGM1P36871 562 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 HPCAP84074 193 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 FUT5Q11128 374 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 GPAT3Q53EU6 434 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 Q71RC1 249 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 RNF130Q86XS8 419 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 ZNF563Q8TA94 476 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 ZG16BQ96DA0 208 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 Q96MF0 132 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 BCO1Q9HAY6 547 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 ACER3Q9NUN7 267 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 MRGBPQ9NV56 204 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.58□□□□□ -0.07
LINC00628-201ENST00000628516 ANGPT2O15123 496 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 CYTIPO60759 359 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 KRT75O95678 551 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 DIO1P49895 249 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 CHRNEQ04844 493 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 SYT14P1Q58G82 188 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 RETREG3Q86VR2 466 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 SULT2B1O00204 365 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 HMGN4O00479 90 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 HS3ST1O14792 307 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 KRT34O76011 436 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 FESP07332 822 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 TFPIP10646 304 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 OR3A2P47893 321 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 KCNJ10P78508 379 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 LTBQ06643 244 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 ITGADQ13349 1161 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 P2RY6Q15077 328 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 TAB1Q15750 504 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 COX20Q5RI15 118 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00628-201ENST00000628516 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms