RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 GAAP10253 952 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 JUNDP17535 347 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 DEFB103AP81534 67 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CDK3Q00526 305 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 HHEXQ03014 270 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TDGQ13569 410 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 GGTA1PQ4G0N0 100 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM69AQ5T7M9 428 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR52R1Q8NGF1 315 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 MS4A4AQ96JQ5 239 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 FN3KQ9H479 309 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CREBZFQ9NS37 354 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TM7SF3Q9NS93 570 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 REV1Q9UBZ9 1251 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ALX3O95076 343 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SFTPDP35247 375 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 LRIF1Q5T3J3 769 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 DPY19L4Q7Z388 723 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM83CQ9BQN1 747 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 HCAR1Q9BXC0 346 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 UBQLN3Q9H347 655 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 AKIP1Q9NQ31 210 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ATG4BQ9Y4P1 393 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRABD2BA6NFA1 517 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 DVL2O14641 736 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 RAD51DO75771 328 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC14A1Q13336 389 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPR50Q13585 617 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM31Q5JXX7 168 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 NDUFAF7Q7L592 441 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 IL17RDQ8NFM7 739 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 WBP2Q969T9 261 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 FCRL1Q96LA6 429 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SAMD11Q96NU1 681 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 NOX4Q9NPH5 578 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 C1GALT1Q9NS00 363 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 C2orf42Q9NWW7 574 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ABRACLQ9P1F3 81 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 NOX1Q9Y5S8 564 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 A0A087WUU8 490 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 F5H5K5 113 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TP53P04637 393 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC6A11P48066 632 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 HSD11B2P80365 405 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 COX15Q7KZN9 410 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARL14Q8N4G2 192 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR10K1Q8NGX5 313 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SFXN5Q8TD22 340 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 CASD1Q96PB1 797 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 P2RY12Q9H244 342 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 NIPAL2Q9H841 368 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ASB6Q9NWX5 421 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 NTNG1Q9Y2I2 539 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 B4DXG7 233 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TNFRSF10AO00220 468 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 RFXAPO00287 272 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 KCNJ13O60928 360 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SIRPAP78324 504 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 S100A12P80511 92 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPR176Q14439 515 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC9A3R2Q15599 337 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF385BQ569K4 471 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 HTR3DQ70Z44 454 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 P4HA3Q7Z4N8 544 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 HHATLQ9HCP6 504 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 A3GALT2U3KPV4 340 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SNAPC5O75971 98 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 BDKRB2P30411 391 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 DDOSTP39656 456 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 MPP7Q5T2T1 576 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 GAREM2Q75VX8 874 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 DPPA4Q7L190 304 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SFXN2Q96NB2 322 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 INTS14Q96SY0 518 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF225Q9UK10 706 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SHROOM3Q8TF72 1996 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC2A10O95528 541 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms