RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691		J3QKU1	62 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	CLOCK	O15516	846 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	GADD45G	O95257	159 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	LYPD3	O95274	346 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SELENBP1	Q13228	472 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TRIL	Q7L0X0	811 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	BDH2	Q9BUT1	245 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	LUZP4	Q9P127	313 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691		A8MVM7	634 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691		H3BNX3	289 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	GNGT2	O14610	69 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	LDLR	P01130	860 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	MT-ND1	P03886	318 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	THY1	P04216	161 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	CELA3A	P09093	270 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	PEPD	P12955	493 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	RRM2	P31350	389 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	ATP6AP1	Q15904	470 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	LINC00471	Q8N535	108 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	RNF217	Q8TC41	542 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	STK35	Q8TDR2	534 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	GPR137	Q96N19	417 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	REEP1	Q9H902	201 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	OR14I1	A6ND48	311 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TTLL8	A6PVC2	850 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	AQP7	O14520	342 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	EFNA2	O43921	213 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TIPRL	O75663	272 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	DIRAS1	O95057	198 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	IGF2	P01344	180 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	FOXK1	P85037	733 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SPIB	Q01892	262 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	VASN	Q6EMK4	673 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	LILRA2	Q8N149	483 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	GHDC	Q8N2G8	530 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	DDIT4L	Q96D03	193 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	NRBF2	Q96F24	287 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	EPYC	Q99645	322 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	NPAS1	Q99742	590 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	EXO5	Q9H790	373 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	RHCG	Q9UBD6	479 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	BSN	Q9UPA5	3926 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691		B8ZZF3	427 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TNFRSF11B	O00300	401 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	NPIPB7	O75200	414 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	CPN1	P15169	458 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	BMP7	P18075	431 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	LIMS1	P48059	325 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	ARHGDIA	P52565	204 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	NFATC3	Q12968	1075 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	DCST1	Q5T197	706 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	RRM2B	Q7LG56	351 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	OR6S1	Q8NH40	331 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM239	Q8WW34	195 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SARAF	Q96BY9	339 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	FUZ	Q9BT04	418 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SPTA1	P02549	2419 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM72	A0PK05	275 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	OR2T1	O43869	369 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	WISP1	O95388	367 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02

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