RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 ICMTO60725 284 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 UBL4AP11441 157 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 CD36P16671 472 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 RYKP34925 604 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 CD83Q01151 205 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 IL18R1Q13478 541 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 CD226Q15762 336 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 ZFP69Q49AA0 526 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 APOOLQ6UXV4 268 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 ELP5Q8TE02 316 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 IMMP1LQ96LU5 166 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 TRIM2Q9C040 744 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 CENPXA8MT69 81 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 SLC1A7O00341 560 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 SOCS6O14544 535 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 FAM20BO75063 409 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 PPM1BO75688 479 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 LYPD3O95274 346 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 MT-ND2P03891 347 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 NGFRP08138 427 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 OTX2P32243 289 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 IFNGR2P38484 337 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 CASP3P42574 277 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 NUDT6P53370 316 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 KEAP1Q14145 624 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 ZNF613Q6PF04 617 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 NDUFAF7Q7L592 441 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 GRHL3Q8TE85 626 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 PITX2Q99697 317 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 UCK2Q9BZX2 261 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 MYOTQ9UBF9 498 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 A0A0B4J2E0 115 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 A0A1B0GX12 115 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 A0A1W2PQ72 361 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 ZNF264O43296 627 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 PTNP21246 168 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 OR2B6P58173 313 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 EFR3AQ14156 821 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 SSPNQ14714 243 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 PLAG1Q6DJT9 500 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 WDR88Q6ZMY6 472 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 FAM71CQ8NEG0 241 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 TMEM255BQ8WV15 326 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 S100ZQ8WXG8 99 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 LGALS12Q96DT0 336 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 CEP19Q96LK0 163 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.95□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 A0A1B0GWA3 101 aa7.94□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 A0A1W2PQD3 144 aa7.94□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 C21orf140B9A014 251 aa7.94□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 ALG1L2C9J202 215 aa7.94□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 STMND1H3BQB6 276 aa7.94□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 OIP5O43482 229 aa7.94□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 RAD1O60671 282 aa7.94□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 CEACAM1P13688 526 aa7.94□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 CHMP24386 653 aa7.94□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 S100A5P33763 92 aa7.94□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 DLSTP36957 453 aa7.94□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 STAT5AP42229 794 aa7.94□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
THBS3-210ENST00000541576 CCR4P51679 360 aa7.94□□□□□ -1.14
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