RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGHV1-8P0DP01 117 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CX3CR1P49238 355 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAP1AP62834 184 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KCTD11Q693B1 232 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BIVMQ86UB2 503 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AMZ2Q86W34 360 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM25Q86YD3 366 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR4F15Q8NGB8 312 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR10G3Q8NGC4 313 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR5M1Q8NGP8 315 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PAQR8Q8TEZ7 354 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM162AQ96A26 154 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PKMYT1Q99640 499 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM121Q9BTD3 319 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM106BQ9NUM4 274 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UVRAGQ9P2Y5 699 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF98A6NK75 572 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MBTPS2O43462 519 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LGI1O95970 557 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PARP6Q2NL67 630 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM52BQ4KMG9 183 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CFAP58Q5T655 872 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CNTN4Q8IWV2 1026 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLHL7Q8IXQ5 586 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCNYQ8ND76 341 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACTRT1Q8TDG2 376 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CORO2AQ92828 525 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADIPOR1Q96A54 375 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VMP1Q96GC9 406 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GAL3ST1Q99999 423 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHAC1Q9BUX1 264 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DEFB127Q9H1M4 99 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC25A51Q9H1U9 297 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C12orf10Q9HB07 376 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RETNQ9HD89 108 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SIGLEC7Q9Y286 467 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OOEPA6NGQ2 149 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PP2D1A8MPX8 630 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AKR1B1P15121 316 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPR2P20594 1047 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC11A1P49279 550 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARL6IP1Q15041 203 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SS18Q15532 418 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VAX1Q5SQQ9 334 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C1orf186Q6ZWK4 172 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRT74Q7RTS7 529 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NT5DC3Q86UY8 548 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM69Q86WT6 500 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR4A16Q8NH70 328 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR9G1Q8NH87 305 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CREB3L1Q96BA8 519 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF607Q96SK3 696 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSPYL1Q9H0U9 437 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C20orf85Q9H1P6 137 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HMG20AQ9NP66 347 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDH7Q9ULB5 785 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 V9GY05 133 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COL4A1P02462 1669 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A6NIZ1 184 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TTI1O43156 1089 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CRCPO75575 148 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CASTP20810 708 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMOD1P28289 359 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OPRK1P41145 380 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAP1BP61224 184 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBX1P62877 108 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACVR1Q04771 509 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SRYQ05066 204 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM136Q6ZRR5 245 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BATF2Q8N1L9 274 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 APCDD1LQ8NCL9 501 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM45BQ96B21 275 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 P2RY13Q9BPV8 354 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NEK6Q9HC98 313 aa-0.39□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms