RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MESD	Q14696	234 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM16L	Q309B1	348 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PMF1	Q6P1K2	205 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM110	Q86TL2	294 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	FGGY	Q96C11	551 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PELI1	Q96FA3	418 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TGM7	Q96PF1	710 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MCHR1	Q99705	422 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	IL36G	Q9NZH8	169 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	NYAP2	Q9P242	653 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		3.09	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP10A	O60312	1499 aa		3.09	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	RERE	Q9P2R6	1566 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	LRP5L	A4QPB2	252 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284		E7ESA3	106 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	ARPC3	O15145	178 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	PRKY	O43930	277 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	HCN1	O60741	890 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	LAP3	P28838	519 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	CD80	P33681	288 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	DRD3	P35462	400 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	KIR2DS2	P43631	304 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	P2RY1	P47900	373 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	PRKX	P51817	358 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	ARFIP1	P53367	373 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	RIPK4	P57078	832 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	AANAT	Q16613	207 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	KYAT1	Q16773	422 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	TPGS2	Q68CL5	300 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	RAPGEF5	Q92565	580 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	NEIL2	Q969S2	332 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	MARC2	Q969Z3	335 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	C16orf74	Q96GX8	76 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	CYYR1	Q96J86	154 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	RHBG	Q9H310	441 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	VCX2	Q9H322	139 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	EHD1	Q9H4M9	534 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	SCML2	Q9UQR0	700 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	MEMO1	Q9Y316	297 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	NPAT	Q14207	1427 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP10B	O94823	1461 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	AGL	P35573	1532 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	HSMCR30	P0CW71	290 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	PNMT	P11086	282 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC130	P13994	396 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF44	P15621	663 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	IGLL1	P15814	213 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	ANXA13	P27216	316 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PTPRK-215	ENST00000498284	LEP	P41159	167 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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