RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa20.54■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 A0A0J9YW62 118 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 A8MV72 311 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 ALG1L2C9J202 215 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 NDUFAB1O14561 156 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 F12P00748 615 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 IGKV1D-16P01601 117 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 ACP2P11117 423 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 KHKP50053 298 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 TAB1Q15750 504 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 DUSP5Q16690 384 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 PAGE3Q5JUK9 113 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 FIGNL1Q6PIW4 674 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 COX18Q8N8Q8 333 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 GPR151Q8TDV0 419 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 SLC9A6Q92581 669 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 NEUROG1Q92886 237 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 GRIP2Q9C0E4 1043 aa20.53■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 TNFSF11O14788 317 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 ADAM11O75078 769 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 NGFRP08138 427 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 ADH6P28332 368 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 PGGHGQ32M88 737 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 PLPPR5Q32ZL2 321 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 MMEL1Q495T6 779 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 SFRP5Q5T4F7 317 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 ATAD3BQ5T9A4 648 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 ALKBH2Q6NS38 261 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 TFAP2EQ6VUC0 442 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 BCAS4Q8TDM0 211 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 HSD17B8Q92506 261 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 JADE3Q92613 823 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 PMM1Q92871 262 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 C16orf58Q96GQ5 468 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 OR7D2Q96RA2 312 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 POLE3Q9NRF9 147 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 FBXO34Q9NWN3 711 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 ARMCX1Q9P291 453 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa20.52■□□□□ 0.88
SIMC1-208ENST00000495423 GXYLT2A0PJZ3 443 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 CLIC1O00299 241 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 NDUFS7O75251 213 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 OPN1LWP04000 364 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 GSNP06396 782 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 FAM157CP0CG43 387 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 BMP2P12643 396 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 PDSS1Q5T2R2 415 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 HBMQ6B0K9 141 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 DHDDSQ86SQ9 333 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 RETREG3Q86VR2 466 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 SNX32Q86XE0 403 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 RNF128Q8TEB7 428 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 ROPN1LQ96C74 230 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 RNF145Q96MT1 663 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 SH3GL1Q99961 368 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 SLC6A13Q9NSD5 602 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 MED17Q9NVC6 651 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 GID8Q9NWU2 228 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 ANK2Q01484 3957 aa20.51■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 EVPLLA8MZ36 301 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 FBP2O00757 339 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 NDUFB5O43674 189 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 KCNK2O95069 426 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 COX4I1P13073 169 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 ME2P23368 584 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 IL32P24001 234 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 MVDP53602 400 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 NFYCQ13952 458 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 TSC22D1Q15714 1073 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 RNF130Q86XS8 419 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 KBTBD8Q8NFY9 601 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 OSTF1Q92882 214 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 HS6ST2Q96MM7 605 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 CGREF1Q99674 301 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM2Q9C040 744 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 OR51I1Q9H343 314 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 SERHL2Q9H4I8 314 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM185BQ9H7F4 350 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa20.5■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 CD8AP01732 235 aa20.49■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 FESP07332 822 aa20.49■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 GPX2P18283 190 aa20.49■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 BSPH1Q075Z2 132 aa20.49■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 FAPQ12884 760 aa20.49■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 GNA13Q14344 377 aa20.49■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SIMC1-208ENST00000495423 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms