RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 A0A087WZ39 114 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP23-1A1A580 65 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 IGSF23A1L1A6 192 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 A6NHS1 94 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 MYMKA6NI61 221 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 LIPT2A6NK58 231 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 A8MXK9 166 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 PATE3B3GLJ2 98 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 NPIPA3F8WFD2 350 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 KRIT1O00522 736 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 PGRMC2O15173 223 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 FMO6PO60774 539 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC22O60826 627 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SDC3O75056 442 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 PALMO75781 387 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 RBBP9O75884 186 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 GJB6O95452 261 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 F13A1P00488 732 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 EPOP01588 193 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CYP11A1P05108 521 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 MMEP08473 750 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 C8orf89P0DMQ9 161 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 PYGMP11217 842 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 COX6A1P12074 109 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CCL5P13501 91 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 EEF2P13639 858 aaKnown RBP-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 GABRA1P14867 456 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CPA3P15088 417 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 NELFEP18615 380 aaKnown RBP-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SRMP19623 302 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 ATP2B4P23634 1241 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 NFKBIAP25963 317 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TMOD1P28289 359 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 AQP1P29972 269 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CDC25AP30304 524 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 GDI1P31150 447 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CCR7P32248 378 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 MYCNOSP40205 109 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CA7P43166 264 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 MAGEA12P43365 314 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 COPAP53621 1224 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CLRN1P58418 232 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 FXYD6P3P58550 94 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 NIPAL4Q0D2K0 466 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 DHRS2Q13268 280 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 BTN1A1Q13410 526 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 PLS1Q14651 629 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 GANABQ14697 944 aaKnown RBP-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 DLGAP5Q15398 846 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SURF1Q15526 300 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 NDUFA9Q16795 377 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 ASPRV1Q53RT3 343 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 C10orf55Q5SWW7 151 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 FNBP1LQ5T0N5 605 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 HHATQ5VTY9 493 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 MYSM1Q5VVJ2 828 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 C9orf57Q5W0N0 161 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM270Q6UE05 265 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TPTE2Q6XPS3 522 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 C9orf139Q6ZV77 190 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TLK2Q86UE8 772 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 PLPP6Q8IY26 295 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 EFCAB13Q8IY85 973 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF595Q8IYB9 648 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 DSELQ8IZU8 1212 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 MYO1HQ8N1T3 1032 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 SVOPQ8N4V2 548 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF454Q8N9F8 522 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 ACOT4Q8N9L9 421 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM229BQ8NBD8 167 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 GSTCDQ8NEC7 633 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 OR9K2Q8NGE7 335 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 OR4X2Q8NGF9 303 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 OR6Y1Q8NGX8 325 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 OR13G1Q8NGZ3 307 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 OR2L2Q8NH16 312 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 CMTM2Q8TAZ6 248 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 NPRL2Q8WTW4 380 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 DNAJB3Q8WWF6 145 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 PLEKHB2Q96CS7 222 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM101Q96IK0 257 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 NGLY1Q96IV0 654 aa-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP-2.35□□□□□ -2.79
SNORD54-201ENST00000459159 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP-2.35□□□□□ -2.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms