RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 CD52P31358 61 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL3P39023 403 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 P2RY4P51582 365 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SORDQ00796 357 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFA6Q01524 100 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CHIT1Q13231 466 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ADNP2Q6IQ32 1131 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXL22Q6P050 247 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL9Q6T311 187 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB2Q8N680 514 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 WDSUB1Q8N9V3 476 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 IFI44Q8TCB0 444 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RAD51AP1Q96B01 352 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TBX5Q99593 518 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS29Q9UBQ0 182 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0D9SEW6 157 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0G2JK05 382 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PPK0 400 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PQH9 124 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 C5orf52A6NGY3 159 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 E9PI62 339 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 H7BY64 318 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CIDEAO60543 219 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF11O60813 436 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GBAP04062 536 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CPN1P15169 458 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SPI1P17947 270 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GCGRP47871 477 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00303Q3SY05 128 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL26Q53HC5 615 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DCAF12L2Q5VW00 463 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF626Q68DY1 528 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MOB3CQ70IA8 216 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 IQCHQ86VS3 1027 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6V1Q8N148 313 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC39A11Q8N1S5 342 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SPPL3Q8TCT6 385 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 THEM6Q8WUY1 208 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PINK1Q9BXM7 581 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RDH14Q9HBH5 336 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TDP1Q9NUW8 608 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PPE2 198 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PR64 198 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 E7EQ34 232 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2CO00762 179 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GOSR2O14653 212 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SNAPC5O75971 98 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PRG2P13727 222 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TBXA2RP21731 343 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFSF4P23510 183 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PPT1P50897 306 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM122BQ7Z309 247 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SULF2Q8IWU5 870 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 VOPP1Q96AW1 172 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ORAI1Q96D31 301 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZDHHC12Q96GR4 267 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM68Q96MH6 324 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF75AQ96N20 296 aa7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms