RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 C12orf73Q69YU5 71 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 Q6ZVL8 140 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CMTM4Q8IZR5 234 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 BBS1Q8NFJ9 593 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SMIM4Q8WVI0 70 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR8D1Q8WZ84 308 aa15.49■□□□□ 0.07
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PACS1-201ENST00000320580 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
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PACS1-201ENST00000320580 OR51S1Q8NGJ8 323 aa15.48■□□□□ 0.07
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PACS1-201ENST00000320580 PTDSS2Q9BVG9 487 aa15.48■□□□□ 0.07
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PACS1-201ENST00000320580 TCEA2Q15560 299 aa15.48■□□□□ 0.07
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PACS1-201ENST00000320580 ELP5Q8TE02 316 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ASB11Q8WXH4 323 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 PIGQQ9BRB3 760 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SLC25A19Q9HC21 320 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 B4GALT6Q9UBX8 382 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SLC2A10O95528 541 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ADH1AP07327 375 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 GZMMP51124 257 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ZNF385BQ569K4 471 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR56A1Q8NGH5 318 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR2AG1Q9H205 316 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CBLCQ9ULV8 474 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
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PACS1-201ENST00000320580 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 GATCO43716 136 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SCGNO76038 276 aa15.47■□□□□ 0.07
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PACS1-201ENST00000320580 MANEALQ5VSG8 457 aa15.47■□□□□ 0.07
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PACS1-201ENST00000320580 DBIP07108 87 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 FPR3P25089 353 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR1D2P34982 312 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CAMLGP49069 296 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SLC29A4Q7RTT9 530 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR2AP1Q8NGE2 309 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR1S2Q8NGQ3 325 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 KLK6Q92876 244 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SLC7A7Q9UM01 511 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 MED16Q9Y2X0 877 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 SLC38A8A6NNN8 435 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 AQP8O94778 261 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 NUDT14O95848 222 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 FRKP42685 505 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
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PACS1-201ENST00000320580 ZNF792Q3KQV3 632 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CLEC9AQ6UXN8 241 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 CD163Q86VB7 1156 aa15.47■□□□□ 0.07
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PACS1-201ENST00000320580 P2RY12Q9H244 342 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 NOX4Q9NPH5 578 aa15.47■□□□□ 0.07
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PACS1-201ENST00000320580 GLP1RP43220 463 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR2W3Q7Z3T1 314 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 POMGNT2Q8NAT1 580 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 FAM71CQ8NEG0 241 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 HS6ST2Q96MM7 605 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 OR6C68A6NDL8 312 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD61A6NGH8 418 aa15.46■□□□□ 0.07
PACS1-201ENST00000320580 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa15.46■□□□□ 0.07
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