RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 TAS2R8Q9NYW2 309 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CACNA1EQ15878 2313 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 GKN3PP0CG01 181 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TRIM23P36406 574 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM52BQ4KMG9 183 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TRAV18A0A075B6X5 111 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 KRBOX1C9JBD0 128 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 GFYI3L273 518 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ACOT7O00154 380 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PRH1P02810 166 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.147e-7■■■■■ 63.5
TRPC1-201ENST00000273482 OR3A2P47893 321 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 VEGFCP49767 419 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PRKXP51817 358 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CEBPGP53567 150 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 RDH10Q8IZV5 341 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ANGPTL6Q8NI99 470 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 OR1E3Q8WZA6 343 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CST11Q9H112 138 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SLC52A3Q9NQ40 469 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TAAR2Q9P1P5 351 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 EDARQ9UNE0 448 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 RLFQ13129 1914 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CD38P28907 300 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA1024LP59773 190 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 GALK2Q01415 458 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF527Q8NB42 609 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 OR13H1Q8NG92 308 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 GHSRQ92847 366 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 DDOQ99489 341 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CENPMQ9NSP4 180 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 MKL2Q9ULH7 1088 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 RNH1P13489 461 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 FXYD6P3P58550 94 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TSC22D1Q15714 1073 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PATE1Q8WXA2 126 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 A4GALTQ9NPC4 353 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 WDR90Q96KV7 1748 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 A0A0A6YYJ9 748 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 I3L1I5 382 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TPBGQ13641 420 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ARFRP1Q13795 201 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ABHD4Q8TB40 342 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 RSPRY1Q96DX4 576 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 C16orf58Q96GQ5 468 aa15.9■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 A8MVJ9 347 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 LDB3O75112 727 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 DBIP07108 87 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 IGFALSP35858 605 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 MMP21Q8N119 569 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 OR52N1Q8NH53 320 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF350Q9GZX5 532 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 TRABD2BA6NFA1 517 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 GPR89AB7ZAQ6 455 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 RDH16O75452 317 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 GPR89BP0CG08 455 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 PPP2CBP62714 309 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 PPP2CAP67775 309 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 ALG10BQ5I7T1 473 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 FCRLAQ7L513 359 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM185AQ8NFB2 350 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 OR2L5Q8NG80 312 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 SERGEFQ9UGK8 458 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 SLC23A1Q9UHI7 598 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 FBXO45P0C2W1 286 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 GIMD1P0DJR0 217 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 CSRP3P50461 194 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 ZBTB37Q5TC79 503 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 BPIFA2Q96DR5 249 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 SFXN2Q96NB2 322 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 WDFY2Q96P53 400 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 APBB3O95704 486 aa15.88■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 HBQ1P09105 142 aa15.88■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 CRYBB2P43320 205 aa15.88■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 WNT3P56703 355 aa15.88■□□□□ 0.13
TRPC1-201ENST00000273482 SDR9C7Q8NEX9 313 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms