RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PHB2	Q99623	299 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PRR14	Q9BWN1	585 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	JAM3	Q9BX67	310 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM82	A0PJX8	343 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SOCS6	O14544	535 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ABCD4	O14678	606 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	NDUFA2	O43678	99 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FGF18	O76093	207 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PSMB10	P40306	273 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	IL13RA1	P78552	427 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	LINC00303	Q3SY05	128 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MTMR11	A4FU01	709 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	OR5H14	A6NHG9	310 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	DCTD	P32321	178 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	KHK	P50053	298 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CAP1	Q01518	475 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	GAB1	Q13480	694 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MAPK14	Q16539	360 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FRMD1	Q8N878	549 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	OR2L3	Q8NG85	312 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF75A	Q96N20	296 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	INTS14	Q96SY0	518 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	C5AR2	Q9P296	337 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ACOD1	A6NK06	481 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PRAMEF11	O60813	436 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PMP2	P02689	132 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	C6	P13671	934 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MAP3K8	P41279	467 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	XCR1	P46094	333 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RAB4B	P61018	213 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TOMM20	Q15388	145 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RNF180	Q86T96	592 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PDXP	Q96GD0	296 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	LMF1	Q96S06	567 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	OSER1	Q9NX31	292 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	AQP8	O94778	261 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CSF1	P09603	554 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ITGB8	P26012	769 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	VAMP2	P63027	116 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	UQCC3	Q6UW78	93 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	USP53	Q70EK8	1073 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	OR1F2P	Q96R84	312 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FBRS	Q9HAH7	460 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	AP4M1	O00189	453 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SCN2B	O60939	215 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FGF2	P09038	288 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF44	P15621	663 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	OR3A2	P47893	321 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ACTB	P60709	375 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ACTG1	P63261	375 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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